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本文介绍了在openSUSE系统中安装GROMACS的详细步骤,包括如何先在系统中安装GNOME桌面环境,再进行GROMACS的安装。教程步骤清晰,旨在帮助用户顺利完成openSUSE下的GROMACS配置。
本文目录导读:
GROMACS是一款高性能的分子动力学模拟软件,广泛应用于生物化学、物理学和材料科学等领域,在openSUSE系统中安装GROMACS,可以让科研工作者更加便捷地进行分子动力学模拟,本文将详细介绍在openSUSE系统中安装GROMACS的步骤。
准备工作
1、确保你的openSUSE系统已更新到最新版本,可以使用以下命令更新系统:
```
sudo zypper update
```
2、安装必要的依赖包,GROMACS依赖于一些外部库和工具,以下命令将安装这些依赖:
```
sudo zypper install git cmake gfortran openmpi openmpi-devel fftw3 fftw3-devel
```
下载GROMACS源代码
1、访问GROMACS的官方网站(https://www.gromacs.org/),找到最新版本的源代码下载链接。
2、使用wget命令下载源代码:
```
wget https://ftp.gromacs.org/gromacs/gromacs-2021.2.tar.gz
```
3、解压下载的源代码:
```
tar -zxf gromacs-2021.2.tar.gz
```
编译安装GROMACS
1、进入解压后的源代码目录:
```
cd gromacs-2021.2
```
2、创建一个构建目录并进入:
```
mkdir build && cd build
```
3、使用cmake配置编译选项:
```
cmake ..
```
在这个步骤中,你可以根据需要添加一些编译选项,
```
cmake -DGMX_MPI=ON ..
```
这将启用MPI并行计算支持。
4、编译GROMACS:
```
make
```
5、安装GROMACS:
```
sudo make install
```
验证安装
1、运行以下命令检查GROMACS版本:
```
gmx version
```
如果返回正确版本信息,则表示安装成功。
2、可以通过运行以下命令来测试GROMACS是否正常工作:
```
gmx mdrun -version
```
如果返回正确版本信息,则表示GROMACS安装无误。
至此,你已经成功在openSUSE系统中安装了GROMACS,下面是50个与本文相关的中文关键词:
openSUSE, GROMACS, 安装, 分子动力学, 模拟, 生物化学, 物理学, 材料科学, 依赖, 更新, 源代码, 编译, 配置, 版本, 测试, 软件包, 下载, 解压, 构建目录, 编译选项, MPI, 并行计算, 安装命令, 验证, 安装成功, 模拟软件, 计算机模拟, 科学研究, 高性能, 生物医学, 药物设计, 计算生物学, 计算化学, 蛋白质折叠, 模型构建, 动力学模拟, 力场, 水合作用, 聚合物, 晶体学, 热力学, 结构生物学, 分子动力学模拟, 计算机辅助设计, 分子对接, 虚拟筛选, 药物筛选, 分子动力学模拟软件, 高通量筛选, 计算机辅助药物设计, 药物开发, 药物优化, 药物分子设计
本文标签属性:
openSUSE GROMACS 安装:opensuse软件安装