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[Linux操作系统]Ubuntu 下安装与使用 Quantum ESPRESSO,开启材料模拟新篇章|,Ubuntu Quantum ESPRESSO

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在Ubuntu操作系统中安装与使用Quantum ESPRESSO,为材料模拟领域开启了新的篇章。Quantum ESPRESSO是款强大的开源软件,能够进行量子力学计算,特别适用于材料科学领域。安装过程简单,只需按照几个步骤即可完成。通过Ubuntu和Quantum ESPRESSO的结合,研究人员可以更加高效地进行材料模拟,为科学研究和工业应用带来新的突破。

本文目录导读:

  1. Ubuntu简介
  2. Quantum ESPRESSO简介
  3. 安装Quantum ESPRESSO
  4. 使用Quantum ESPRESSO

Quantum ESPRESSO是一款强大的开源量子力学软件,广泛应用于材料科学、化学、物理等领域,用于研究材料的电子结构和动力学特性,本文将详细介绍如何在Ubuntu操作系统下安装与使用Quantum ESPRESSO,帮助科研人员和学者更好地开展相关研究。

Ubuntu简介

Ubuntu是一款基于Debian的免费、开源的Linux操作系统,以其稳定、安全、易用等特点在全球范围内拥有大量用户,Ubuntu提供了丰富的软件资源,支持多种编程语言和开发工具,是科研人员和研究生的首选操作系统。

Quantum ESPRESSO简介

Quantum ESPRESSO是一套基于密度泛函理论(DFT)的软件包,主要用于计算材料的电子结构和动力学特性,它包括多个模块,如 PWscf、Phonopy、QuantumAT、Wannier90等,可以用于结构优化、动力学模拟、电子态分析等多种任务。

安装Quantum ESPRESSO

1、安装依赖

在安装Quantum ESPRESSO之前,需要先安装一些依赖库,打开终端,输入以下命令:

sudo apt-get update
sudo apt-get install fftw3-mpi libfftw3-mpi-dev fftw3-threaded libfftw3-threaded-dev gfortran openmpi-bin openmpi-dev

2、下载源代码

访问Quantum ESPRESSO的官方网站(http://www.quantum-espresso.org/),下载最新版本的源代码,将下载的文件解压到指定目录。

3、编译安装

在终端中,切换到源代码目录,执行以下命令:

make all

编译完成后,将生成的可执行文件移动到便于访问的目录,如/usr/local/bin/

使用Quantum ESPRESSO

1、结构优化

结构优化是材料模拟的基本任务之一,以下是一个简单的结构优化示例:

(1)准备输入文件

创建一个名为input.in的文件,写入以下内容

&control
    calculation = 'relax',
    prefix = 'Al',
    outdir = './',
    pseudo_dir = '/path/to/pseudo',
    verbosity = 'high'
/
&system
    ibrav = 2,
    celldm(1) = 4.05,
    nat = 1,
    ntyp = 1,
    ecutwfc = 20,
    ecutrho = 100
/
&electrons
    diagonalization = 'davidson',
    mixing_beta = 0.7,
    conv_thr = 1.0d-8
/
ATOMIC_SPECIES
Al 26.9815431 Al.pbe-n-van.UPF
ATOMIC_POSITIONS
Al 0.0 0.0 0.0
K_POINTS
Gamma

(2)运行计算

在终端中,执行以下命令:

pw.x < input.in > output.out

计算完成后,查看output.out文件,可以得到优化后的结构参数。

2、动力学模拟

动力学模拟是研究材料性质的重要手段,以下是一个简单的动力学模拟示例:

(1)准备输入文件

创建一个名为input.in的文件,写入以下内容:

&control
    calculation = 'md',
    prefix = 'Al',
    outdir = './',
    pseudo_dir = '/path/to/pseudo',
    verbosity = 'high'
/
&system
    ibrav = 2,
    celldm(1) = 4.05,
    nat = 1,
    ntyp = 1,
    ecutwfc = 20,
    ecutrho = 100
/
&electrons
    diagonalization = 'davidson',
    mixing_beta = 0.7,
    conv_thr = 1.0d-8
/
&ions
    ions_typ = 'ion'
/
ATOMIC_SPECIES
Al 26.9815431 Al.pbe-n-van.UPF
ATOMIC_POSITIONS
Al 0.0 0.0 0.0
K_POINTS
Gamma

(2)运行计算

在终端中,执行以下命令:

md.x < input.in > output.out

计算完成后,查看output.out文件,可以得到动力学模拟的结果。

本文详细介绍了在Ubuntu操作系统下安装与使用Quantum ESPRESSO的方法,通过掌握这款强大的材料模拟工具,科研人员和学者可以更加高效地开展材料研究,为我国材料科学领域的发展贡献力量。

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