推荐阅读:
[AI-人工智能]免翻墙的AI利器:樱桃茶·智域GPT,让你轻松使用ChatGPT和Midjourney - 免费AIGC工具 - 拼车/合租账号 八折优惠码: AIGCJOEDISCOUNT2024
[AI-人工智能]银河录像局: 国内可靠的AI工具与流媒体的合租平台 高效省钱、现号秒发、翻车赔偿、无限续费|95折优惠码: AIGCJOE
[AI-人工智能]免梯免翻墙-ChatGPT拼车站月卡 | 可用GPT4/GPT4o/o1-preview | 会话隔离 | 全网最低价独享体验ChatGPT/Claude会员服务
[AI-人工智能]边界AICHAT - 超级永久终身会员激活 史诗级神器,口碑炸裂!300万人都在用的AI平台
本文详细介绍了在openSUSE操作系统中安装和配置LAMMPS(大规模原子/分子大规模并行模拟器)的步骤,旨在帮助用户顺利搭建模拟环境,提升科研工作效率。
本文目录导读:
LAMMPS(Large-scale AtoMic/Molecular Massively Parallel Simulator)是一款广泛使用的开源分子动力学模拟软件,适用于多种材料科学、生物物理和化学领域的研究,本文将详细介绍如何在openSUSE操作系统下配置LAMMPS,帮助读者顺利完成安装和基本设置。
准备工作
1、确保您的openSUSE系统已更新到最新版本。
2、安装必要的编译工具和依赖库:
```
sudo zypper install gcc gcc-c++ make automake autoconf libfftw3_omp-dev
```
下载LAMMPS源代码
1、访问LAMMPS官方网站(https://lammps.sandia.gov/)下载最新版本的源代码。
2、将下载的源代码包解压到指定目录,/home/username/lammps/src
。
配置LAMMPS
1、进入LAMMPS源代码目录:
```
cd /home/username/lammps/src
```
2、创建一个新的Makefile文件,用于指定编译选项和依赖库:
```
cp Makefile.gcc Makefile
```
3、编辑Makefile文件,根据您的openSUSE系统配置进行以下修改:
- 将CC
和CXX
设置为gcc
和g++
。
- 将 Precision
设置为double
。
- 取消注释-DLAMMPS yöneuron
行,以启用神经元动力学模块。
- 取消注释-DLAMMPSaspera
行,以启用Aspera MD模块。
示例Makefile配置如下:
```
CC = gcc
CXX = g++
Precision = double
#LAMMPS神经元动力学模块
LAMMPS神经元动力学模块 = yes
#LAMMPS Aspera MD模块
LAMMPSaspera = yes
```
4、编译LAMMPS:
```
make
```
如果编译过程中出现错误,请检查Makefile文件中的配置是否正确,并确保已安装所有依赖库。
5、编译完成后,会在src
目录下生成lmp
可执行文件。
测试LAMMPS
1、运行以下命令,测试LAMMPS是否可以正常工作:
```
/home/username/lammps/src/lmp -in in.lj
```
in.lj
是LAMMPS的一个示例输入文件。
2、如果LAMMPS能够正常运行,您将看到以下输出信息:
```
LAMMPS (27 Nov 2021)
...
```
LAMMPS常用操作
1、运行LAMMPS:
```
lmp -in input_file
```
input_file
是您自定义的输入文件。
2、查看LAMMPS版本信息:
```
lmp -v
```
3、查看LAMMPS支持的命令:
```
lmp -h
```
本文详细介绍了在openSUSE操作系统下配置LAMMPS的步骤,通过遵循上述指南,您应该能够成功安装并运行LAMMPS,您可以开始学习LAMMPS的使用,开展分子动力学模拟研究。
关键词:
openSUSE, LAMMPS, 配置, 编译, 安装, Makefile, 模块, 神经元动力学, Aspera MD, 输入文件, 运行, 版本信息, 命令, 分子动力学模拟, 研究工具, 源代码, 依赖库, 编译器, 精度, 测试, 输出信息, 常用操作, 使用指南, 学习, 模拟, 材料科学, 生物物理, 化学, 科学研究, 计算机模拟, 模拟软件, 开源, 大规模并行计算, 动力学模拟, 物理模型, 算法, 性能优化, 并行计算, 软件开发, 计算机编程, 系统配置, 操作系统兼容性, 软件安装, 软件升级, 软件维护, 技术支持, 社区支持, 用户手册, 教程, 学习资源, 应用案例, 学术交流, 论文发表, 科研成果, 软件应用, 软件优化, 计算机辅助设计, 计算机辅助工程, 计算机辅助模拟, 计算机辅助教学, 计算机辅助科研
本文标签属性:
openSUSE LAMMPS 配置:opensuse i3wm