[Linux操作系统]openSUSE 下 LAMMPS 的详细配置指南|opensuse i3wm,openSUSE LAMMPS 配置,Linux操作系统,云主机博士

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本文详细介绍在openSUSE操作系统下，如何配置LAMMPS分子动力学模拟软件。内容涵盖从系统环境准备到LAMMPS的安装、编译及优化，特别针对openSUSE i3wm桌面环境进行了详细说明。

本文目录导读：

安装依赖软件
下载LAMMPS源代码
编译LAMMPS
配置LAMMPS
测试LAMMPS
使用LAMMPS

LAMMPS（大规模原子/分子大规模并行模拟器）是一款强大的分子动力学模拟软件，广泛应用于材料科学、生物物理、化学等领域，在openSUSE操作系统下配置LAMMPS，需要遵循一定的步骤，本文将为您详细介绍如何在openSUSE上安装和配置LAMMPS。

安装依赖软件

在安装LAMMPS之前，需要先安装一些依赖软件，打开终端，输入以下命令：

sudo zypper install git cmake gfortran fftw3

这将会安装Git、CMake、gfortran编译器和FFTW库，这些是编译LAMMPS所必需的。

下载LAMMPS源代码

从LAMMPS官方网站（https://lammps.sandia.gov/）下载最新版本的源代码，您可以使用Git命令克隆仓库，也可以直接下载压缩包。

1、使用Git克隆仓库：

git clone https://github.com/lammps/lammps.git

2、或者下载压缩包：

wget https://lammps.sandia.gov/下载链接
tar -xzvf lammps-版本号.tar.gz

编译LAMMPS

1、进入LAMMPS源代码目录：

cd lammps/src

2、创建一个构建目录：

mkdir build
cd build

3、使用CMake配置项目：

cmake ..

4、编译LAMMPS：

make

编译完成后，您会在lammps/src/目录下找到一个名为lmp的可执行文件。

配置LAMMPS

1、创建一个配置文件：

cp ../ lammps/src/lmp -r /usr/local/bin

2、打开配置文件，修改以下内容：

prefix=/usr/local
bindir=${prefix}/bin
libdir=${prefix}/lib
includedir=${prefix}/include
docdir=${prefix}/share/doc/lammps
mandir=${prefix}/share/man
enable-mpi=ON

3、保存并关闭配置文件。

4、编译LAMMPS：

make install

测试LAMMPS

为了验证LAMMPS是否安装成功，您可以运行以下命令：

lmp

如果LAMMPS能够正常启动，并显示版本信息，则表示安装成功。

使用LAMMPS

安装完成后，您可以使用LAMMPS进行分子动力学模拟，以下是一个简单的示例：

1、创建一个名为in.lj的输入文件，内容如下：

2D Lennard-Jones melt
units           lj
dimension       2
atom_style      atomic
boundary        p p f
neighbor        0.5 bin
neigh_list      0.5 bin
kspace          pppm 0.1 0.1 10000
read_data       data.lj
pair_style      lj/cut 2.5
pair_coeff      1 1 1.0 1.0 2.5
velocity        all create 1.0 87287 loop local
fix             1 all nve
run             100

2、运行LAMMPS：

lmp -in in.lj

LAMMPS将根据输入文件进行模拟，并在终端显示模拟结果。

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