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本文详细介绍了在Ubuntu操作系统下安装与配置GROMACS模拟软件的步骤，包括安装必要的依赖库GSL。内容涵盖了从源代码编译安装到环境配置的完整过程，为用户提供了清晰的指导。
本文目录导读：
随着科学研究的不断发展，分子动力学模拟已成为生物学、化学和物理学等领域的重要工具，GROMACS（Groningen Machine for Chemical Simulations）是一款高性能的分子动力学模拟软件，广泛应用于生物大分子的模拟研究，本文将详细介绍如何在Ubuntu系统下安装和配置GROMACS，帮助读者快速上手。
安装前准备
1、系统要求：本文以Ubuntu 18.04 LTS为例，其他版本的Ubuntu操作步骤类似。
2、安装依赖：在安装GROMACS之前，需要安装一些依赖库，打开终端，输入以下命令：
sudo apt-get update sudo apt-get install -y cmake gfortran git build-essential libfftw3-dev libfftw3-3 libopenmpi-dev libopenmpi1.10 libmpich-dev libmpich2.5-dev
下载GROMACS源代码
1、访问GROMACS官方网站（https://www.gromacs.org/），找到最新版本的源代码下载链接。
2、在终端中使用wget命令下载源代码，
wget https://ftp.gromacs.org/gromacs/gromacs-2021.2.tar.gz
3、解压下载的源代码：
tar -zxvf gromacs-2021.2.tar.gz
编译与安装GROMACS
1、进入解压后的文件夹：
cd gromacs-2021.2
2、创建一个构建目录：
mkdir build && cd build
3、使用cmake配置编译选项：
cmake ..
4、编译GROMACS：
make
5、安装GROMACS：
sudo make install
配置环境变量
1、打开终端，输入以下命令编辑bashrc文件：
sudo nano ~/.bashrc
2、在文件末尾添加以下内容：
export GROMACS_ROOT=/usr/local/gromacs export PATH=$PATH:$GROMACS_ROOT/bin export LD_LIBRARY_PATH=$LD_LIBRARY_PATH:$GROMACS_ROOT/lib
3、保存并退出文件。
4、在终端中输入以下命令使环境变量生效：
source ~/.bashrc
测试GROMACS安装
1、在终端中输入以下命令运行GROMACS版本信息：
gmx --version
2、如果返回了GROMACS的版本信息，说明安装成功。
本文详细介绍了在Ubuntu系统下安装和配置GROMACS的步骤，包括安装依赖、下载源代码、编译与安装、配置环境变量等，通过以上步骤，用户可以成功安装GROMACS并进行分子动力学模拟研究。
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本文标签属性：
Ubuntu GROMACS 安装：ubuntu安装 grub
