推荐阅读:
[AI-人工智能]免翻墙的AI利器:樱桃茶·智域GPT,让你轻松使用ChatGPT和Midjourney - 免费AIGC工具 - 拼车/合租账号 八折优惠码: AIGCJOEDISCOUNT2024
[AI-人工智能]银河录像局: 国内可靠的AI工具与流媒体的合租平台 高效省钱、现号秒发、翻车赔偿、无限续费|95折优惠码: AIGCJOE
[AI-人工智能]免梯免翻墙-ChatGPT拼车站月卡 | 可用GPT4/GPT4o/o1-preview | 会话隔离 | 全网最低价独享体验ChatGPT/Claude会员服务
[AI-人工智能]边界AICHAT - 超级永久终身会员激活 史诗级神器,口碑炸裂!300万人都在用的AI平台
本文详细介绍如何在openSUSE系统中配置LAMMPS,涵盖网络设置和LAMMPS的安装与配置步骤,旨在帮助用户顺利在openSUSE环境下运行LAMMPS进行物理模拟。
本文目录导读:
LAMMPS(大规模原子/分子大规模并行模拟器)是一款强大的分子动力学模拟软件,广泛应用于材料科学、生物物理、化学等领域,在openSUSE系统中配置LAMMPS,可以让科研工作者更加方便地进行相关研究,本文将详细介绍在openSUSE系统中配置LAMMPS的步骤。
安装依赖
在配置LAMMPS之前,需要先安装一些依赖库,打开终端,输入以下命令:
sudo zypper install gcc gcc-c++ git make cmake
这将会安装GCC编译器、Git版本控制工具、Make构建工具和CMake跨平台构建系统。
下载LAMMPS源代码
从LAMMPS的官方网站(https://lammps.sandia.gov/)下载最新版本的源代码,或者使用Git克隆LAMMPS的源代码仓库:
git clone https://github.com/lammps/lammps.git
这将会在当前目录下创建一个名为lammps
的文件夹,其中包含LAMMPS的源代码。
编译LAMMPS
进入lammps
文件夹,使用CMake构建LAMMPS:
cd lammps/src mkdir build && cd build cmake .. make
编译完成后,在lammps/src/build
目录下会生成一个名为lmp
的可执行文件。
配置LAMMPS
LAMMPS提供了多种预编译的版本,包括串行版本、MPI并行版本、GPU加速版本等,以下以配置MPI并行版本为例进行说明。
1、安装MPI库
在openSUSE系统中,可以使用以下命令安装MPI库:
sudo zypper install openmpi
2、编译MPI并行版本
在lammps/src
目录下,创建一个新的构建目录:
mkdir build-mpi && cd build-mpi
使用CMake配置MPI并行版本:
cmake -DUSE_MPI=ON .. make
编译完成后,在lammps/src/build-mpi
目录下会生成一个名为lmp_mpi
的可执行文件。
测试LAMMPS
为了验证LAMMPS是否配置成功,可以运行一个简单的测试案例,在lammps/src
目录下,执行以下命令:
cd examples ./lmp_mpi -in in.lj
in.lj
是一个Lennard-Jones液体的模拟输入文件,如果LAMMPS运行正常,将会在终端输出模拟结果。
使用LAMMPS进行模拟
配置好LAMMPS后,就可以使用它进行分子动力学模拟了,以下是一个简单的示例:
1、创建模拟输入文件
在LAMMPS的examples
目录下,复制一个示例输入文件,例如in.lj
,然后根据需要进行修改。
2、运行模拟
在终端中,执行以下命令:
./lmp_mpi -in in.lj
LAMMPS将根据输入文件进行模拟,并在终端输出结果。
本文详细介绍了在openSUSE系统中配置LAMMPS的步骤,包括安装依赖、下载源代码、编译、配置和使用,通过这些步骤,用户可以在openSUSE系统中成功安装和运行LAMMPS,为分子动力学模拟提供强大的支持。
关键词:
openSUSE, LAMMPS, 配置, 编译, MPI, 依赖库, 模拟, 输入文件, 终端, 源代码, 克隆, GPU, 串行, 并行, 测试, 液体, 分子动力学, 材料科学, 生物物理, 化学研究, Make, CMake, GCC, Git, openmpi, Lennard-Jones, 模拟结果, 模拟输入, 运行模拟
本文标签属性:
openSUSE LAMMPS 配置:opensuse ip配置