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[Linux操作系统]Ubuntu 下 LAMMPS 的安装与配置详解|ubuntu lammps安装教程,Ubuntu LAMMPS 配置

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本文详细介绍了在Ubuntu操作系统下安装与配置LAMMPS(大规模原子/分子大规模并行模拟器)步骤。内容包括从源代码编译安装、依赖库的安装、环境变量的配置以及LAMMPS的测试运行,旨在帮助用户顺利完成LAMMPS的安装和配置。

本文目录导读:

  1. 安装前的准备
  2. 编译安装LAMMPS
  3. 配置LAMMPS
  4. 测试LAMMPS

LAMMPS(Large-scale Atomic/Molecular Massively Parallel Simulator)是一款开源的分子动力学模拟软件,广泛应用于材料科学、生物物理、化学等领域,在Ubuntu操作系统下安装和配置LAMMPS,可以让科研人员更加高效地进行模拟计算,本文将详细介绍如何在Ubuntu系统中安装和配置LAMMPS。

安装前的准备

1、安装依赖库

在安装LAMMPS之前,需要先安装一些依赖库,打开终端,执行以下命令:

sudo apt-get update
sudo apt-get install build-essential libfftw3-dev libmpich-dev libopenmpi-dev

2、下载LAMMPS源代码

从LAMMPS官网(https://lammps.sandia.gov/)下载最新版本的源代码,将下载的文件解压到指定目录。

编译安装LAMMPS

1、编译LAMMPS

进入LAMMPS源代码目录,执行以下命令:

make yes-all
make

这将会编译所有可选的LAMMPS模块。

2、安装LAMMPS

编译完成后,执行以下命令将LAMMPS安装到系统:

sudo make install

配置LAMMPS

1、设置环境变量

为了方便使用LAMMPS,需要将LAMMPS的安装路径添加到环境变量中,打开终端,执行以下命令:

sudo gedit /etc/profile

在打开的文件中,找到“export PATH”这一行,将其修改为:

export PATH=$PATH:/usr/local/lammps/bin

保存并关闭文件,然后执行以下命令使环境变量生效:

source /etc/profile

2、配置LAMMPS参数

在LAMMPS安装目录下,有一个名为“lammps.src”的文件,该文件包含了LAMMPS的参数设置,根据实际需求,修改该文件中的相关参数,如线程数、内存分配等。

测试LAMMPS

在终端中输入以下命令,运行LAMMPS自带的示例脚本:

lmp_serial -in in.lj

如果LAMMPS能够正常运行并输出模拟结果,说明安装和配置成功。

本文详细介绍了在Ubuntu系统中安装和配置LAMMPS的步骤,通过安装依赖库、编译安装LAMMPS、设置环境变量和配置参数,科研人员可以轻松地在Ubuntu系统中使用LAMMPS进行分子动力学模拟。

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Ubuntu LAMMPS 配置:ubuntu lammps安装教程

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