[Linux操作系统]Ubuntu下LAMMPS的安装与配置指南|ubuntu lamp搭建教程,Ubuntu LAMMPS 配置,Linux操作系统,云主机博士

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本文详细介绍在Ubuntu操作系统下安装与配置LAMMPS（大规模原子/分子大规模并行模拟器）的步骤，包括环境搭建、依赖关系解决、源码编译及配置过程，为科研工作者和开发者提供清晰的Ubuntu LAMMPS搭建教程。

本文目录导读：

安装LAMMPS所需的环境
安装依赖包
下载LAMMPS源代码
编译LAMMPS
配置LAMMPS
测试LAMMPS

随着计算机科学和材料科学的不断发展，分子动力学模拟成为了科研工作的重要工具之一，LAMMPS（Large-scale AtoMic/Molecular Massively Parallel Simulator）是一款高性能的分子动力学模拟软件，广泛应用于材料科学、生物物理、化学等领域，本文将详细介绍在Ubuntu操作系统下如何安装和配置LAMMPS，帮助读者快速上手。

安装LAMMPS所需的环境

在安装LAMMPS之前，需要确保系统环境满足以下要求：

1、操作系统：Ubuntu 18.04/20.04

2、编译器：GCC 4.8及以上版本

3、数学库：BLAS和LAPACK

4、Python：2.7或3.x版本（用于运行脚本）

安装依赖包

打开终端，更新系统软件包列表：

sudo apt update

安装编译器和数学库：

sudo apt install build-essential
sudo apt install libfftw3-dev
sudo apt install libopenmpi-dev

如果需要Python支持，还需要安装Python及其开发包：

sudo apt install python3 python3-dev

下载LAMMPS源代码

从LAMMPS官方网站（https://lammps.sandia.gov/）下载最新版本的源代码，这里以2021年9月发布的版本为例，下载命令如下：

wget https://lammps.sandia.gov下载链接

将下载的文件解压到指定目录：

tar -zxvf lammmps-2021-09-15.tar.gz
cd lammmps-2021-09-15

编译LAMMPS

在LAMMPS源代码目录下，创建一个名为“make”的文件夹，用于存放编译生成的文件：

mkdir make
cd make

根据需要选择编译选项，以下是一个常用的编译选项示例：

make yes-all
make intel64

make yes-all命令用于选择编译所有的LAMMPS功能模块，make intel64命令用于指定编译为64位Intel处理器架构。

编译完成后，在make目录下会生成一个名为“lmp”的可执行文件。

配置LAMMPS

将LAMMPS可执行文件移动到系统路径下，方便全局调用：

sudo cp lmp /usr/local/bin/

配置LAMMPS的环境变量，打开~/.bashrc文件，添加以下内容：

export PATH=$PATH:/usr/local/bin
export LAMMPS_SRC=/path/to/lammps-2021-09-15/src
export LAMMPS_MAKE=/path/to/lammps-2021-09-15/make

保存并关闭文件，然后在终端中运行以下命令使环境变量生效：

source ~/.bashrc

测试LAMMPS

在终端中输入以下命令，测试LAMMPS是否安装成功：

lmp -echo log

如果返回以下信息，则表示LAMMPS安装成功：

LAMMPS (17 Sep 2021)

至此，LAMMPS在Ubuntu下的安装与配置就完成了，您可以使用LAMMPS进行分子动力学模拟，探索材料科学的奥秘。

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