[Linux操作系统]Ubuntu下LAMMPS的详细配置指南|ubuntu lammps安装教程,Ubuntu LAMMPS 配置,Linux操作系统,云主机博士

[Linux操作系统]Ubuntu下LAMMPS的详细配置指南|ubuntu lammps安装教程,Ubuntu LAMMPS 配置

[AI-人工智能]免翻墙的AI利器：樱桃茶·智域GPT，让你轻松使用ChatGPT和Midjourney - 免费AIGC工具 - 拼车/合租账号八折优惠码: AIGCJOEDISCOUNT2024

[AI-人工智能]银河录像局: 国内可靠的AI工具与流媒体的合租平台高效省钱、现号秒发、翻车赔偿、无限续费|95折优惠码: AIGCJOE

[AI-人工智能]免梯免翻墙-ChatGPT拼车站月卡 | 可用GPT4/GPT4o/o1-preview | 会话隔离 | 全网最低价独享体验ChatGPT/Claude会员服务

[AI-人工智能]边界AICHAT - 超级永久终身会员激活史诗级神器，口碑炸裂！300万人都在用的AI平台

本文详细介绍如何在Ubuntu操作系统下安装和配置LAMMPS（大规模原子/分子大规模并行模拟器）。指南涵盖了从安装依赖包到编译LAMMPS源代码的完整步骤，旨在帮助用户在Ubuntu环境中顺利搭建LAMMPS模拟环境。

本文目录导读：

安装依赖
下载LAMMPS源代码
编译LAMMPS
运行LAMMPS

LAMMPS（Large-scale Atomic/Molecular Massively Parallel Simulator）是一款广泛使用的开源分子动力学模拟软件，适用于各种材料、生物和化学系统的模拟，在Ubuntu操作系统下配置LAMMPS，可以充分利用其强大的并行计算能力，本文将详细介绍如何在Ubuntu系统中安装和配置LAMMPS。

安装依赖

1、安装编译器

确保系统中安装了C++编译器g++，可以使用以下命令进行安装：

sudo apt-get update
sudo apt-get install g++

2、安装并行计算库

LAMMPS支持并行计算，需要安装MPI（Message Passing Interface）库，可以使用以下命令安装OpenMPI：

sudo apt-get install libopenmpi-dev

3、安装PythOn库

LAMMPS的Python接口需要Python开发库和numpy库，可以使用以下命令安装：

sudo apt-get install python-dev
sudo apt-get install python-numpy

下载LAMMPS源代码

访问LAMMPS官网（https://lammps.sandia.gov/）下载最新版本的源代码，将下载的源代码文件（lammps-2021-10-21.tar.gz）解压到指定目录。

编译LAMMPS

1、进入LAMMPS源代码目录：

cd lammps-2021-10-21/src

2、创建一个名为“make”的文件夹，用于存放编译生成的文件：

mkdir make

3、编写Makefile文件

在“make”文件夹中创建一个名为“Makefile”的文件，并添加以下内容：

Compiler
CC = mpicxx
CXX = mpicxx
CFLAGS = -O3 -std=c++11
MPI_INC = -I/usr/include/openmpi-x86_64
Libraries
LMP_INC = -I..
LMP_LIB = -L.. -llammps
Object files
OBJECTS = 
 atom.o 
 atom_vec.o 
 atom_type.o 
 comm.o 
 domain.o 
 error.o 
 force.o 
 group.o 
 group.cpp.o 
 integrate.o 
 memory.o 
 neighbor.o 
 neighborhood.o 
 newton.o 
 npair.o 
 npair.cpp.o 
 region.o 
 update.o
Rules
all: lmp
lmp: $(OBJECTS)
	$(CXX) $(CFLAGS) $(LMP_INC) $(MPI_INC) $(OBJECTS) $(LMP_LIB) -o lmp
clean:
	rm -f lmp $(OBJECTS)

4、编译LAMMPS

在“make”文件夹中执行以下命令编译LAMMPS：

make

编译完成后，在“make”文件夹中会生成一个名为“lmp”的可执行文件。

运行LAMMPS

1、将LAMMPS可执行文件移动到便于访问的目录：

sudo mv make/lmp /usr/local/bin/

2、运行LAMMPS

在终端中输入以下命令运行LAMMPS：

lmp

LAMMPS会进入交互式模式，可以输入各种命令进行模拟。

本文详细介绍了在Ubuntu操作系统下安装和配置LAMMPS的过程，通过编译LAMMPS源代码，可以充分利用其强大的并行计算能力，为各种材料、生物和化学系统的模拟提供支持。

以下是50个中文相关关键词：

Ubuntu, LAMMPS, 配置, 编译, 安装, 依赖, MPI, Python, 源代码, Makefile, 可执行文件, 运行, 模拟, 材料科学, 生物科学, 化学反应, 分子动力学, 计算机模拟, 并行计算, 高性能计算, 软件安装, 编译器, 库, 优化, 性能, 源码编译, 环境配置, 科学计算, 跨平台, 开源软件, 学术研究, 计算机辅助设计, 计算机辅助工程, 虚拟实验, 计算机模拟技术, 计算机应用, 计算机科学与技术, 计算生物学, 计算化学, 计算材料学, 计算物理, 计算力学, 计算流体力学, 计算地质学, 计算天体物理学, 计算经济学, 计算心理学, 计算社会学, 计算教育学, 计算医学

本文标签属性：

Ubuntu LAMMPS 配置：ubuntu laptopmode