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[Linux操作系统]openSUSE 系统下 LAMMPS 的配置与安装指南|opensuse i3wm,openSUSE LAMMPS 配置

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本文详细介绍了在openSUSE系统中配置与安装LAMMPS的步骤,包括在opensuse i3wm环境下进行相关设置。指南涵盖了从系统准备、依赖项安装到LAMMPS编译的完整过程,为用户提供了清晰的安装路径。

本文目录导读:

  1. 系统环境准备
  2. 下载 LAMMPS 源码
  3. 配置 LAMMPS
  4. 编译 LAMMPS
  5. 测试 LAMMPS

LAMMPS(大规模原子/分子大规模并行模拟器)是一款强大的分子动力学模拟软件,广泛应用于材料科学、生物物理、化学等领域,本文将为您详细介绍如何在 openSUSE 系统下配置和安装 LAMMPS。

系统环境准备

1、更新系统软件包

开始安装 LAMMPS 之前,请确保您的 openSUSE 系统已更新到最新版本,打开终端,执行以下命令:

sudo zypper update

2、安装编译环境

LAMMPS 需要编译安装,因此需要安装编译器及依赖库,执行以下命令安装编译环境:

sudo zypper install gcc gcc-c++ make automake autoconf

下载 LAMMPS 源码

访问 LAMMPS 官方网站(https://lammps.sandia.gov/),下载最新版本的源码,本文以 2021 年 10 月 1 日发布的 2021-10-1 版本为例,下载源码包:

wget https://lammps.sandia.gov/下载地址

将下载的源码包解压到指定目录:

tar -zxvf lammps-2021-10-1.tar.gz
cd lammps-2021-10-1

配置 LAMMPS

LAMMPS 提供了多种编译选项,可以根据需要选择合适的编译选项,以下是一个基本的配置过程:

1、创建一个名为Makefile 的文件,用于存放编译选项。

nano Makefile

2、在Makefile 文件中,设置编译器、编译器选项、库路径等,以下是一个示例配置:

CC = gcc
CXX = g++
 mpicxx = mpicxx
基本编译选项
COPT = -O3 -fopenmp
LOPT = -fopenmp
添加其他编译选项,如:-DLAMMPS大方差优化、-DUSE_MEAM等

3、保存并关闭Makefile 文件。

编译 LAMMPS

在终端中,执行以下命令编译 LAMMPS:

make yes-styles # 选择编译的模块
make

编译完成后,会在src 目录下生成一个名为lmp 的可执行文件。

测试 LAMMPS

为了验证 LAMMPS 是否安装成功,可以执行以下命令运行一个简单的测试:

cd examples
./lmp -in in.lj

如果一切正常,LAMMPS 将运行一个 Lennard-Jones 模拟,并在终端输出相关信息。

本文详细介绍了在 openSUSE 系统下配置和安装 LAMMPS 的过程,通过以上步骤,您可以在 openSUSE 系统上成功安装 LAMMPS,并进行分子动力学模拟,需要注意的是,LAMMPS 的编译选项众多,具体配置应根据实际需求进行调整。

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