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[Linux操作系统]openSUSE 系统下 LAMMPS 的详细配置指南|opensuse配置网络,openSUSE LAMMPS 配置

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本文详细介绍在openSUSE系统中配置LAMMPS的步骤,包括openSUSE网络设置及LAMMPS安装与优化。通过逐步指导,帮助用户顺利完成配置,以实现高效的科学计算。

本文目录导读:

  1. 安装编译环境和依赖库
  2. 下载和编译 LAMMPS
  3. 配置 LAMMPS
  4. 测试 LAMMPS

LAMMPS(大规模原子/分子大规模并行模拟器)是一款广泛使用的开源分子动力学模拟软件,适用于多种材料科学和生物物理领域的研究,在 openSUSE 系统下配置 LAMMPS 可以让用户充分利用该系统的稳定性和高效性,下面将详细介绍如何在 openSUSE 系统下安装和配置 LAMMPS。

安装编译环境和依赖库

1、更新系统软件包

确保您的 openSUSE 系统是最新的,打开终端,执行以下命令:

sudo zypper refresh
sudo zypper update

2、安装编译环境

LAMMPS 需要编译环境,因此需要安装 GCC 编译器和相关库:

sudo zypper install gcc gcc-c++ make

3、安装依赖库

LAMMPS 支持多种可选的库,以下是一些常用的依赖库:

sudo zypper install fftw3 fftw3-mpi boost boost-math

下载和编译 LAMMPS

1、下载 LAMMPS 源代码

从 LAMMPS 官方网站(https://lammps.sandia.gov/)下载最新版本的源代码,将下载的文件解压到指定目录。

2、编译 LAMMPS

进入解压后的 LAMMPS 源代码目录,执行以下命令:

make yes-all
make

这将编译所有可选的 LAMMPS 功能,如果只需要特定的功能,可以在make 命令前添加相应的make yes-<feature> 命令。

3、安装 LAMMPS

编译完成后,将生成的可执行文件lmp 移动到/usr/local/bin 目录下,以便全局访问:

sudo cp src/lmp_*.exe /usr/local/bin/

配置 LAMMPS

1、设置环境变量

为了让 LAMMPS 正常运行,需要在 shell 配置文件(如.bashrc.zshrc)中添加以下环境变量:

export PATH=$PATH:/usr/local/bin
export LAMMPS_ROOT=<LAMMPS源代码目录>

2、配置 LAMMPS 参数

在 LAMMPS 源代码目录下,有一个名为lammps.src 的文件,该文件包含了 LAMMPS 的默认参数设置,用户可以根据自己的需求修改该文件中的参数,例如修改并行计算的核心数、内存分配等。

测试 LAMMPS

1、运行测试案例

在 LAMMPS 源代码目录下,有一个名为bench 的目录,其中包含了多个测试案例,运行以下命令来测试 LAMMPS 是否正常工作:

lmp -in bench/in.lj

2、查看输出结果

在终端中查看输出结果,确保没有错误信息,如果一切正常,LAMMPS 已经成功安装和配置。

在 openSUSE 系统下配置 LAMMPS 需要一定的耐心和技巧,但通过以上步骤,用户可以顺利地完成安装和配置,LAMMPS 强大的分子动力学模拟功能将为科研工作提供有力支持。

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openSUSE LAMMPS 配置:opensuse 15.2

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