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[Linux操作系统]openSUSE系统中LAMMPS的安装与配置详解|opensuse使用教程,openSUSE LAMMPS 配置

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本文详细介绍了在openSUSE系统中安装与配置LAMMPS(大规模原子/分子大规模并行模拟器)的步骤。内容包括从源代码编译安装LAMMPS,以及相关的依赖库安装和配置,旨在帮助用户在openSUSE环境下高效使用LAMMPS进行科学计算。

本文目录导读:

  1. openSUSE系统简介
  2. LAMMPS简介
  3. 安装LAMMPS所需的依赖
  4. 下载和编译LAMMPS
  5. 配置LAMMPS
  6. LAMMPS常用命令

在科学计算领域,LAMMPS(大规模原子/分子大规模并行模拟器)是一款强大的分子动力学模拟软件,本文将详细介绍如何在openSUSE系统中安装和配置LAMMPS,帮助读者快速上手这款软件。

openSUSE系统简介

openSUSE是一款基于Linux内核的自由和开源操作系统,具有稳定性高、安全性强、自由度高、可定制性强等特点,它适用于服务器、桌面和笔记本电脑等多种场景。

LAMMPS简介

LAMMPS是一款开源的分子动力学模拟软件,可以用于模拟固体、液体、气体等多种物质的微观结构,LAMMPS支持多种力场模型,如经典力场、嵌入原子法、分子动力学等,LAMMPS还具有强大的并行计算能力,可以在高性能计算机上实现大规模模拟。

安装LAMMPS所需的依赖

在安装LAMMPS之前,需要先安装以下依赖:

1、GCC编译器

2、Make工具

3、FFTW库(用于快速傅里叶变换)

4、MPI库(用于并行计算)

以下是在openSUSE系统中安装这些依赖的步骤:

1、打开终端,输入以下命令安装GCC编译器和Make工具:

sudo zypper install gcc make

2、安装FFTW库:

sudo zypper install fftw3 fftw3-threaded

3、安装MPI库:

sudo zypper install openmpi openmpi-devel

下载和编译LAMMPS

1、访问LAMMPS官网(https://lammps.sandia.gov/),下载最新版本的源代码压缩包。

2、将下载的压缩包解压到指定目录,例如/home/username/lammps

3、打开终端,进入LAMMPS源代码目录,执行以下命令编译LAMMPS:

make yes-all
make

4、编译完成后,会在目录下生成一个名为lmp的可执行文件。

配置LAMMPS

1、创建一个名为lammps.in的输入文件,输入以下内容:

units			metal
dimension		3
boundary		ppo
atom_style		atomic

2、在终端中,运行以下命令启动LAMMPS:

./lmp < lammps.in

3、如果LAMMPS能够正常运行,说明配置成功。

LAMMPS常用命令

以下是一些LAMMPS的常用命令:

1、region:定义模拟区域

2、create_box:创建模拟盒子

3、create_atoms:创建原子

4、set:设置参数

5、run:运行模拟

6、dump:输出结果

本文详细介绍了在openSUSE系统中安装和配置LAMMPS的步骤,希望对读者有所帮助,通过掌握LAMMPS的使用,读者可以更好地进行分子动力学模拟,为科研工作提供有力支持。

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openSUSE LAMMPS 配置:opensuse使用教程

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