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[Linux操作系统]openSUSE系统中LAMMPS的详细配置指南|opensuse i3wm,openSUSE LAMMPS 配置

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本文详细介绍了在openSUSE系统中配置LAMMPS的步骤,包括在opensuse i3wm环境下进行的相关设置。内容涵盖了安装LAMMPS及其依赖包、配置环境变量、编译与安装过程,以及可能出现的问题和解决方案。

本文目录导读:

  1. 安装依赖
  2. 下载LAMMPS源码
  3. 编译LAMMPS
  4. 配置LAMMPS
  5. 注意事项

LAMMPS(大规模原子/分子大规模并行模拟器)是一款广泛使用的开源分子动力学模拟软件,适用于各种材料科学的模拟研究,本文将详细介绍如何在openSUSE系统中安装和配置LAMMPS,帮助用户顺利完成安装并开始模拟。

安装依赖

在安装LAMMPS之前,需要确保系统中安装了一些必要的依赖库,以下是在openSUSE系统中安装依赖库的步骤:

1、打开终端,输入以下命令更新系统:

```

sudo zypper refresh

sudo zypper update

```

2、安装编译器和相关库:

```

sudo zypper install gcc gcc-c++ make cmake git

sudo zypper install boost boost-devel

sudo zypper install fftw3 fftw3-devel

sudo zypper install openmpi openmpi-devel

```

下载LAMMPS源码

1、访问LAMMPS官方网站(https://lammps.sandia.gov/)或GitHub仓库(https://github.com/lammps/lammps),下载最新版本的LAMMPS源码。

2、将下载的源码包解压到指定目录,例如/home/username/lammps

编译LAMMPS

1、进入LAMMPS源码目录,创建一个构建目录:

```

cd /home/username/lammps

mkdir build

cd build

```

2、使用CMake配置LAMMPS项目:

```

cmake ..

```

如果需要添加特定的编译选项,可以在CMake命令中添加相应的参数,启用MPI并行计算:

```

cmake -DENABLE_MPI=on ..

```

3、开始编译LAMMPS:

```

make

```

编译完成后,在src 目录下会生成lmp 可执行文件。

配置LAMMPS

1、创建一个LAMMPS配置文件,例如lammps.in,并添加以下内容:

```

# 提示符设置

prompt on

echo on

# 读取数据文件

read_data data.file

# 设置模拟盒子尺寸

boundary p p p

units metal

atom_style atomic

# 设置初始速度

velocity all create 300.0 4928459

# 初始化模拟

run 0

```

2、将lammps.in 文件与LAMMPS可执行文件放在同一目录下。

3、运行LAMMPS:

```

./lmp < lammps.in > lammps.out

```

运行过程中,LAMMPS会在lammps.out 文件中输出相关信息。

注意事项

1、确保在编译LAMMPS时启用了所需的模块和库,以满足特定模拟需求。

2、如果在编译过程中遇到错误,可以查阅LAMMPS官方文档或向社区寻求帮助。

3、运行LAMMPS时,可以根据需要修改配置文件中的参数,以适应不同的模拟场景。

4、在使用LAMMPS进行大规模并行计算时,请确保系统具备足够的计算资源。

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仅供参考,实际操作时请根据具体情况调整,希望本文能对您在openSUSE系统中配置LAMMPS有所帮助。

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openSUSE LAMMPS 配置:opensuse15.3

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