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本文详细介绍了在Ubuntu环境下安装与配置LAMMPS的步骤，包括安装必要的依赖包、下载LAMMPS源代码、编译安装以及配置相关环境。通过本教程，用户可轻松在Ubuntu系统中部署LAMMPS，为后续的分子动力学模拟提供支持。
本文目录导读：
在科学计算领域，LAMMPS（大规模原子/分子大规模并行模拟器）是一款功能强大的分子动力学模拟软件，本文将详细介绍如何在Ubuntu环境下安装和配置LAMMPS，帮助读者快速上手并顺利开展相关研究。
安装依赖库
在安装LAMMPS之前，需要先安装一系列依赖库，打开终端，输入以下命令：
sudo apt-get update sudo apt-get install build-essential sudo apt-get install libfftw3-dev sudo apt-get install libmpich-dev mpich sudo apt-get install libgsl-dev
这些命令将安装编译器、FFTW库、MPICH并行计算库和GSL数学库等依赖项。
下载LAMMPS源代码
访问LAMMPS官方网站（https://lammps.sandia.gov/）下载最新版本的源代码，将下载的文件保存在一个合适的目录下，例如/home/username/lammps。
编译LAMMPS
1、解压源代码包：
tar -xzvf lammps-2021-10-20.tar.gz
2、进入解压后的目录：
cd lammps-2021-10-20
3、编译LAMMPS：
make yes-mpich make yes-gsl make
这些命令将编译支持MPICH并行计算和GSL数学库的LAMMPS版本。
配置LAMMPS
1、创建一个新的配置文件：
cp src/lmp_eam.cpp.src src/lmp_eam.cpp
2、修改配置文件：
打开src/lmp_eam.cpp文件，找到以下代码行：
```c++
// if you want to use the KIM library, uncomment the following Line:
// #define USE_KIM
将其修改为： ```c++ #define USE_KIM
3、重新编译LAMMPS：
make
运行LAMMPS
1、进入示例目录：
cd examples
2、运行示例脚本：
mpirun -np 4 lmp_eam -in in.eam
这条命令将使用4个进程运行LAMMPS，并执行名为in.eam的输入文件。
常见问题与解决方法
1、编译时出现“找不到mpich.h”错误：
请检查是否已安装libmpich-dev库，并确保库路径正确。
2、编译时出现“找不到gsl.h”错误：
请检查是否已安装libgsl-dev库，并确保库路径正确。
3、运行LAMMPS时出现“无法打开文件”错误：
请检查输入文件的路径是否正确，并确保文件具有可读权限。
4、运行LAMMPS时出现“无法分配内存”错误：
请检查计算机的内存容量是否足够，或尝试减小模拟系统的规模。
以下是50个与本文相关的中文关键词：
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本文标签属性：
Ubuntu LAMMPS 配置：ubuntu lapack
