推荐阅读:
[AI-人工智能]免翻墙的AI利器：樱桃茶·智域GPT，让你轻松使用ChatGPT和Midjourney - 免费AIGC工具 - 拼车/合租账号 八折优惠码: AIGCJOEDISCOUNT2024
[AI-人工智能]银河录像局: 国内可靠的AI工具与流媒体的合租平台 高效省钱、现号秒发、翻车赔偿、无限续费|95折优惠码: AIGCJOE
[AI-人工智能]免梯免翻墙-ChatGPT拼车站月卡 | 可用GPT4/GPT4o/o1-preview | 会话隔离 | 全网最低价独享体验ChatGPT/Claude会员服务
[AI-人工智能]边界AICHAT - 超级永久终身会员激活 史诗级神器，口碑炸裂！300万人都在用的AI平台
本文提供了在Ubuntu 18操作系统下安装与配置GROMACS的详细步骤，旨在帮助用户顺利完成安装过程。指南涵盖了从系统环境准备到软件编译安装的各个环节，为科研人员和开发者提供了便捷的参考。
本文目录导读：
GROMACS是一款高性能的分子动力学模拟软件，广泛用于生物物理、化学和材料科学等领域，在Ubuntu系统中安装GROMACS，可以让我们充分利用Linux系统的强大性能进行高效的模拟计算，本文将详细介绍如何在Ubuntu下安装GROMACS。
安装前的准备工作
1、更新系统
在安装GROMACS之前，首先确保你的Ubuntu系统是最新的，打开终端，输入以下命令：
sudo apt update sudo apt upgrade
2、安装依赖包
GROMACS依赖于一些外部库和工具，因此需要先安装这些依赖包，输入以下命令：
sudo apt install gfortran libopenmpi-dev libfftw3-dev libfftw3-3 libblas-dev liblapack-dev
安装GROMACS
1、下载GROMACS源代码
从GROMACS的官方网站（https://www.gromacs.org/）下载最新版本的源代码，这里以2022年发布的版本为例，输入以下命令：
wget https://github.com/gromacs/gromacs/archive/2022.tar.gz
2、解压源代码
将下载的源代码文件解压到指定目录：
tar -zxvf 2022.tar.gz cd gromacs-2022
3、配置安装
在解压后的目录中，执行以下命令进行配置：
mkdir build && cd build cmake -DGMX_INSTALL_PREFIX=/usr/local/gromacs ..
4、编译安装
在配置完成后，执行以下命令编译并安装GROMACS：
make -j4 sudo make install
这里使用-j4参数表示同时使用4个CPU核心进行编译，你可以根据你的CPU核心数进行调整。
配置环境变量
为了方便使用GROMACS，我们需要将其添加到系统的环境变量中，打开终端，输入以下命令：
sudo nano /etc/profile
在打开的文件中，添加以下内容：
export PATH=/usr/local/gromacs/bin:$PATH export LD_LIBRARY_PATH=/usr/local/gromacs/lib:$LD_LIBRARY_PATH
保存并退出编辑器，然后重启终端或执行以下命令使环境变量生效：
source /etc/profile
验证安装
在终端中输入以下命令，检查GROMACS是否安装成功：
gmx version
如果返回了GROMACS的版本信息，则表示安装成功。
以下为50个中文相关关键词：
Ubuntu, GROMACS, 安装, 配置, 分子动力学, 模拟, 生物物理, 化学, 材料科学, Linux, 系统更新, 依赖包, 源代码, 解压, 配置安装, 编译, 环境变量, 验证, 版本, 高性能, 计算模拟, 动力学模拟, 生物信息学, 药物设计, 计算生物学, 分子力学, 势能函数, 水合模型, 蛋白质折叠, 模拟算法, 优化, 性能测试, 串行计算, 并行计算, GPU加速, 分子动力学模拟软件, 模拟器, 计算化学, 计算物理, 模拟工具, 研究工具, 学术研究, 科学计算, 软件安装, 编译器, 软件配置, 系统环境, 性能优化, 高效计算
本文标签属性：
Ubuntu GROMACS 安装：ubuntu安装gfortran
