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本文详细介绍了在OpenSUSE系统中安装和配置LAMMPS(大规模原子/分子大规模并行模拟器)的步骤。内容涵盖从系统要求、安装依赖包,到编译安装LAMMPS及其不同包的完整过程,旨在帮助用户在openSUSE环境下高效地使用LAMMPS进行物理模拟。
本文目录导读:
LAMMPS(大规模原子/分子大规模并行模拟器)是一款强大的分子动力学模拟软件,广泛应用于材料科学、生物物理、化学等领域,在openSUSE系统中配置LAMMPS,虽然过程相对复杂,但通过以下步骤,您可以顺利完成配置。
准备工作
1、确保您的openSUSE系统已更新到最新版本。
2、安装必要的编译工具和依赖库:
```
sudo zypper install gcc gcc-c++ make cmake git
sudo zypper install fftw3 fftw3-mpi
sudo zypper install boost boost-devel
sudo zypper install openmpi openmpi-devel
```
下载LAMMPS源代码
1、访问LAMMPS官方网站(https://lammps.sandia.gov/)或GitHub仓库(https://github.com/lammps/lammps)下载最新版本的源代码。
2、将下载的源代码压缩包解压到指定目录。
编译LAMMPS
1、进入LAMMPS源代码目录,创建一个构建目录:
```
cd lammps/src
mkdir build
cd build
```
2、使用CMake工具进行编译配置:
```
cmake ..
```
3、根据需要选择编译选项,以下为常用选项:
-DWITH-MPI=ON
:启用MPI并行支持
-DWITH-KOKKOS=ON
:启用Kokkos加速
-DWITH-OPENMP=ON
:启用OpenMP并行支持
4、开始编译:
```
make -j $(nproc)
```
-j $(nproc)
表示使用所有CPU核心进行编译,以提高编译速度。
5、编译完成后,将生成的可执行文件lmp
移动到便于访问的目录。
测试LAMMPS
1、进入LAMMPS测试目录:
```
cd lammps/src/MAKE/OPTIONS/Makefile.<编译选项>
```
其中<编译选项>
为您在编译时选择的选项,如mpi
、kokkos
等。
2、运行测试脚本:
```
make test
```
如果测试通过,表示LAMMPS配置成功。
LAMMPS使用技巧
1、学习LAMMPS的基本命令和参数设置,参考官方文档或相关教程。
2、使用Python等脚本语言与LAMMPS进行交互,提高模拟效率。
3、关注LAMMPS社区,学习最新的模拟方法和技巧。
以下为50个中文相关关键词:
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关键词之间用逗号分隔,无序号。
本文标签属性:
openSUSE LAMMPS 配置:opensuse15.3