推荐阅读:
[AI-人工智能]免翻墙的AI利器:樱桃茶·智域GPT,让你轻松使用ChatGPT和Midjourney - 免费AIGC工具 - 拼车/合租账号 八折优惠码: AIGCJOEDISCOUNT2024
[AI-人工智能]银河录像局: 国内可靠的AI工具与流媒体的合租平台 高效省钱、现号秒发、翻车赔偿、无限续费|95折优惠码: AIGCJOE
[AI-人工智能]免梯免翻墙-ChatGPT拼车站月卡 | 可用GPT4/GPT4o/o1-preview | 会话隔离 | 全网最低价独享体验ChatGPT/Claude会员服务
[AI-人工智能]边界AICHAT - 超级永久终身会员激活 史诗级神器,口碑炸裂!300万人都在用的AI平台
本文介绍了在Ubuntu操作系统下如何安装和配置GROMACS分子模拟软件,包括使用g++编译器的安装过程,详细阐述了安装步骤及可能遇到的问题和解决方案,为用户提供了清晰的安装指南。
本文目录导读:
GROMACS是一款高性能的分子动力学模拟软件,广泛应用于生物物理、化学和材料科学等领域,在Ubuntu系统中安装GROMACS,可以充分利用Linux系统的高效性能,下面将详细介绍如何在Ubuntu下安装和配置GROMACS。
安装依赖
1、更新系统
确保您的Ubuntu系统已更新到最新版本,在终端中输入以下命令:
sudo apt update sudo apt upgrade
2、安装编译器和依赖库
安装编译器:
sudo apt install g++ cmake
安装依赖库:
sudo apt install libfftw3-3 libfftw3-dev libopenmpi-dev openmpi-bin
下载GROMACS源代码
1、访问GROMACS官网(https://www.gromacs.org/),找到最新版本的源代码下载链接。
2、在终端中使用wget命令下载源代码:
wget https://ftp.gromacs.org/gromacs/gromacs-2021.2.tar.gz
3、解压源代码:
tar -zxvf gromacs-2021.2.tar.gz
编译和安装GROMACS
1、切换到解压后的目录:
cd gromacs-2021.2
2、创建一个构建目录并切换到该目录:
mkdir build && cd build
3、使用cmake配置编译选项:
cmake ..
4、编译GROMACS:
make
5、安装GROMACS:
sudo make install
配置环境变量
1、打开终端,输入以下命令编辑bashrc文件:
sudo nano ~/.bashrc
2、在文件末尾添加以下内容:
export PATH=$PATH:/usr/local/gromacs/bin export GMXLIB=/usr/local/gromacs/share/gromacs/top
3、保存并退出编辑器。
4、在终端中输入以下命令使环境变量生效:
source ~/.bashrc
验证安装
在终端中输入以下命令,查看GROMACS版本信息:
gmx version
如果返回了正确的版本信息,则表示GROMACS安装成功。
以下为50个中文相关关键词:
Ubuntu, GROMACS, 安装, 配置, 编译器, 依赖库, 源代码, 下载, 解压, 编译, 安装, 环境变量, 验证, 版本, 更新系统, g++, cmake, fftw3, openmpi, 官网, wget, tar, gzip, build, bashrc, PATH, GMXLIB, gmx, version, 分子动力学, 模拟软件, 生物物理, 化学, 材料科学, 高性能, Linux, 终端, 命令, 文件编辑, 保存, 退出, 生效, 版本信息, 安装教程, 使用方法, 高效性能, 科学研究
本文标签属性:
Ubuntu GROMACS 安装:ubuntu18安装gromacs