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本文介绍了在Ubuntu操作系统下如何配置和安装LAMMPS（大规模原子/分子大规模并行模拟器）的方法。指南详细阐述了安装过程中的步骤，包括依赖关系的解决、源代码编译以及相关环境的设置，旨在帮助用户顺利完成LAMMPS的安装与配置。
本文目录导读：
LAMMPS（Large-scale AtoMic/Molecular Massively Parallel Simulator）是一款广泛用于分子动力学模拟的开源软件，在 Ubuntu 系统下配置和安装 LAMMPS 可以让科研工作者和工程师更加高效地进行物理、化学、生物等领域的模拟研究，本文将详细介绍在 Ubuntu 系统下配置和安装 LAMMPS 的步骤。
安装依赖库
在安装 LAMMPS 之前，需要先安装一些依赖库，打开终端，执行以下命令：
sudo apt-get update sudo apt-get install build-essential libfftw3-dev libmpich-dev libopenmpi-dev
这些命令会安装编译器、FFTW 库（用于快速傅里叶变换）、MPICH 和 OpenMPI（用于并行计算）。
下载 LAMMPS 源代码
从 LAMMPS 官方网站（https://lammps.sandia.gov/）下载最新版本的源代码，可以选择.tar.gz格式的压缩包，将下载的文件移动到 home 目录下，并解压：
cd ~ tar -zxvf lammps-2021-10-08.tar.gz
这里以 lammps-2021-10-08 版本为例。
编译 LAMMPS
进入解压后的文件夹，编译 LAMMPS：
cd lammps-2021-10-08/src make yes-all make
第一个命令进入源代码目录，第二个命令生成 Makefile，第三个命令编译 LAMMPS。
编译完成后，在 src 目录下会生成一个名为lmp 的可执行文件，为了方便使用，可以将其移动到/usr/local/bin目录下：
sudo cp lmp /usr/local/bin/
配置 LAMMPS
LAMMPS 提供了多种预编译的版本，但为了满足不同需求，我们可能需要自定义配置，以下是一些常用的配置选项：
1、并行计算：如果需要使用并行计算，可以选择 MPICH 或 OpenMPI，在 Makefile 中设置相应的参数，如：
make mpi
2、GPU 加速：如果需要使用 GPU 加速，可以在 Makefile 中设置 GPU 相关参数，使用 CUDA：
make cuda
3、包含特定功能：LAMMPS 支持多种可选功能，如用户自定义的力场、原子类型等，在 Makefile 中设置相应的参数，如：
make yes-user-molmodel yes-user-external yes-user-neighbor yes-user-reax
测试 LAMMPS
为了确保 LAMMPS 安装正确，可以运行一个简单的测试案例，在 LAMMPS 安装目录下的 examples 子目录中，有许多示例输入文件，以下是一个简单的测试案例：
cd ~/lammps-2021-10-08/examples/initial lmp -in in.lj
这条命令会运行一个 Lennard-Jones 模型的模拟，如果一切正常，LAMMPS 将输出模拟结果。
本文详细介绍了在 Ubuntu 系统下配置和安装 LAMMPS 的步骤，通过编译和配置，我们可以得到一个适用于自己需求的 LAMMPS 版本，以下是 50 个与本文相关的中文关键词：
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通过掌握这些关键词，用户可以更好地了解 LAMMPS 在 Ubuntu 系统下的配置与安装过程。
本文标签属性：
Ubuntu LAMMPS 配置：ubuntu配置pcl
