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本文提供了在Ubuntu系统下安装GROMACS的完整步骤，包括先安装GNU科学库（GSL），然后详细介绍了如何从源代码编译和安装GROMACS，以实现高效的分子动力学模拟。
本文目录导读：
GROMACS是一款高性能的分子动力学模拟软件，广泛应用于生物物理、化学、材料科学等领域，在Ubuntu系统下安装GROMACS，可以让用户充分利用Linux系统的稳定性和高性能，下面，我们将详细介绍如何在Ubuntu系统上安装GROMACS。
安装前的准备工作
1、更新系统
确保你的Ubuntu系统是最新的，打开终端，输入以下命令：
sudo apt update sudo apt upgrade
2、安装依赖包
GROMACS安装过程中需要一些依赖包，可以使用以下命令安装：
sudo apt install gfortran libfftw3-3-dev libopenmpi-dev mpi-selector openssh-server
下载GROMACS源代码
1、访问GROMACS官网（https://www.gromacs.org/），找到最新版本的源代码。
2、下载源代码压缩包，gromacs-2021.2.tar.gz。
3、将下载的文件移动到Ubuntu系统的合适位置，/home/username/Downloads/。
编译安装GROMACS
1、解压源代码
在终端中，切换到源代码所在的目录，并解压：
cd /home/username/Downloads/ tar -zxvf gromacs-2021.2.tar.gz cd gromacs-2021.2
2、配置编译选项
在终端中，执行以下命令配置编译选项：
./configure --prefix=/usr/local/gromacs --with-mpi
这里，我们将GROMACS安装到/usr/local/gromacs目录下，并启用MPI支持。
3、编译和安装
在终端中，执行以下命令编译和安装GROMACS：
make sudo make install
配置环境变量
为了让系统识别GROMACS，需要配置环境变量，打开终端，输入以下命令：
sudo nano /etc/profile
在打开的文件中，添加以下内容：
export PATH=$PATH:/usr/local/gromacs/bin export LD_LIBRARY_PATH=$LD_LIBRARY_PATH:/usr/local/gromacs/lib
保存并关闭文件，在终端中输入以下命令使环境变量生效：
source /etc/profile
验证安装
在终端中，输入以下命令验证GROMACS安装是否成功：
gmx version
如果返回GROMACS的版本信息，则表示安装成功。
本文详细介绍了在Ubuntu系统下安装GROMACS的步骤，包括更新系统、安装依赖包、下载源代码、编译安装、配置环境变量和验证安装，通过这些步骤，用户可以在Ubuntu系统上成功安装GROMACS，并开始分子动力学模拟研究。
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本文标签属性：
Ubuntu GROMACS 安装：ubuntu18安装gromacs
