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本文详细介绍了在Ubuntu操作系统下安装与配置LAMMPS（大规模原子/分子大规模并行模拟器）的步骤。通过逐步指导，用户可以轻松搭建LAMMPS环境，实现高效的物理模拟计算。
本文目录导读：
LAMMPS（Large-scale Atomic/Molecular Massively Parallel Simulator）是一款开源的分子动力学模拟软件，广泛应用于材料科学、生物物理、化学等领域，本文将详细介绍如何在Ubuntu操作系统下安装和配置LAMMPS。
安装依赖
在安装LAMMPS之前，需要确保系统已安装以下依赖：
1、GCC编译器：LAMMPS需要GCC编译器进行编译，可以使用以下命令安装：
```
sudo apt-get install bUIld-essential
```
2、MPI并行计算库：LAMMPS支持并行计算，需要安装MPI库，可以使用以下命令安装：
```
sudo apt-get install mpich
```
3、其他依赖库：LAMMPS还需要以下库，可以使用以下命令安装：
```
sudo apt-get install libfftw3-dev libjpeg-dev libpng-dev
```
下载LAMMPS源代码
1、访问LAMMPS官方网站（https://lammps.sandia.gov/）下载最新版本的源代码，将下载的文件保存到指定目录。
2、解压源代码：
```
tar -zxvf lammps-2021-11-15.tar.gz
```
编译LAMMPS
1、进入解压后的LAMMPS目录：
```
cd lammps-2021-11-15
```
2、创建一个名为“make”的文件夹用于存放编译生成的文件：
```
mkdir make
```
3、编写Makefile文件，在“make”文件夹中创建一个名为“Makefile”的文件，并写入以下内容：
```
# Define the name of the LAMMPS executable
LAMMPS = lmp_2021-11-15
# Define the location of the LAMMPS source directory
src = $(shell pwd)/src
# Define the location of the LAMMPS include directory
include = $(shell pwd)/src
# Define the location of the LAMMPS lib directory
lib = $(shell pwd)/src
# Define the location of the MPI include directory
MPI_INC = /usr/local/include
# Define the location of the MPI lib directory
MPI_LIB = /usr/local/lib
# Define the compiler flags
CFLAGS = -O3 -fOpenmp -std=c++11
# Define the linking flags
LDFLAGS = -lfftw3 -lm -lpthread -ljpeg -lpng -lm -lstdc++ -fopenmp
# Define the source files
SRCS = $(wildcard $(src)/*.c) $(wildcard $(src)/*.cpp)
# Define the object files
OBJS = $(SRCS:.c=.o) $(SRCS:.cpp=.o)
# Define the rules for compiling the LAMMPS executable
all: $(LAMMPS)
$(LAMMPS): $(OBJS)
$(CC) $(CFLAGS) -o $(LAMMPS) $(OBJS) $(LDFLAGS)
# Define the rules for cleaning the build directory
clean:
rm -f $(OBJS) $(LAMMPS)
```
4、编译LAMMPS：
```
make
```
编译成功后，在“make”文件夹中会生成LAMMPS的可执行文件“lmp_2021-11-15”。
运行LAMMPS
1、进入“make”文件夹：
```
cd make
```
2、运行LAMMPS：
```
./lmp_2021-11-15
```
3、根据需要输入相关命令进行分子动力学模拟。
以下为50个中文相关关键词：
Ubuntu, LAMMPS, 安装, 配置, 编译, 依赖, 源代码, Makefile, MPI, 并行计算, 材料科学, 生物物理, 化学领域, 分子动力学, 模拟软件, 可执行文件, 运行, 命令, 模拟, 材料, 性质, 计算, 优化, 结构, 动力学, 模型, 粒子, 力场, 参数, 数据, 分析, 结果, 可视化, 软件包, 安装包, 编译器, 库, FFTW, JPEG, PNG, 线程, 性能, 优化, 调试, 错误, 解决方案, 使用技巧, 经验分享
本文标签属性：
Ubuntu LAMMPS 配置：ubuntu配置lib
