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本文详细介绍了在Ubuntu环境下安装与配置LAMMPS的步骤，包括如何安装必要的依赖、编译LAMMPS以及配置MPI支持，旨在帮助用户高效地在Ubuntu系统中使用LAMMPS进行分子动力学模拟。
本文目录导读：
LAMMPS（Large-scale Atomic/Molecular Massively Parallel Simulator）是一款广泛用于分子动力学模拟的开源软件，在Ubuntu环境下安装和配置LAMMPS，可以充分利用Linux系统的稳定性和高性能计算资源，本文将详细介绍在Ubuntu环境下安装和配置LAMMPS的步骤。
安装前准备
1、系统要求：建议使用Ubuntu 18.04或更高版本的操作系统。
2、安装依赖：LAMMPS依赖于一些外部库，如BLAS、LAPACK、FFT等，在安装LAMMPS之前，需要先安装这些依赖库。
打开终端，输入以下命令安装依赖：
sudo apt-get update sudo apt-get install gfortran libfftw3-dev libmpich-dev libopenmpi-dev
下载LAMMPS源代码
1、访问LAMMPS官网（https://lammps.sandia.gov/），找到“Download”选项，点击进入。
2、选择适合Ubuntu系统的源代码包，通常为“tar.gz”格式。
3、下载源代码包到本地电脑。
安装LAMMPS
1、将下载的源代码包解压到指定目录，
tar -zxvf lammps-2021-11-11.tar.gz -C /usr/local/
2、进入解压后的目录：
cd /usr/local/lammps-2021-11-11/
3、编译LAMMPS：
make yes-mpich make yes-memalign make
4、检查LAMMPS是否安装成功：
lmp_ubuntu -help
如果出现命令帮助信息，则表示LAMMPS安装成功。
配置LAMMPS
1、创建LAMMPS配置文件：
mkdir -p ~/.lammps touch ~/.lammps/lammps.in
2、打开配置文件，输入以下内容：
units metal dimension 3 boundary p p p atom_style atomic
3、保存并关闭配置文件。
运行LAMMPS
1、创建LAMMPS输入文件，
touch in.lammps
2、打开输入文件，输入以下内容：
units metal dimension 3 boundary p p p atom_style atomic read_data data.lammps pair_style lj/cut 2.5 pair_coeff * * 1.0 1.0 2.5 neighbor 2.0 bin neigh_modify delay 0 every 1 check yes fix 1 all nve thermo 10 dump 1 all atom 10 dump.lammps run 100
3、保存并关闭输入文件。
4、运行LAMMPS：
lmp_ubuntu -in in.lammps
本文详细介绍了在Ubuntu环境下安装和配置LAMMPS的步骤，通过这些步骤，用户可以在Ubuntu系统上成功安装LAMMPS并进行分子动力学模拟，需要注意的是，LAMMPS的安装和配置过程可能会因操作系统版本和硬件环境的不同而有所差异，用户在实际操作时应根据具体情况调整。
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本文标签属性：
Ubuntu LAMMPS 配置：ubuntu lnmp
