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本文详细介绍了在OpenSUSE 15系统中安装GROMACS的步骤，从系统环境配置到软件安装，逐步指导用户完成安装过程，助力科研及开发者高效利用GROMACS进行分子动力学模拟。
本文目录导读：
GROMACS是一款高性能的分子动力学模拟软件，广泛应用于生物信息学、材料科学和化学等领域，在openSUSE系统中安装GROMACS可以帮助科研人员和学者们更好地进行分子动力学模拟，下面将详细介绍在openSUSE系统中安装GROMACS的步骤。
准备工作
1、确保你的openSUSE系统已经更新到最新版本，可以在终端中执行以下命令：
```
sudo zypper refresh
sudo zypper update
```
2、安装编译器和依赖库，在终端中执行以下命令：
```
sudo zypper install git gcc gcc-c++ make cmake boost boost-devel fftw3 fftw3-devel openmpi openmpi-devel
```
下载GROMACS源代码
1、访问GROMACS的官方网站（https://www.gromacs.org/），找到最新版本的源代码下载链接。
2、在终端中使用wget命令下载源代码，
```
wget https://github.com/gromacs/gromacs/releases/download/2021.2/gromacs-2021.2.tar.gz
```
3、解压下载的源代码：
```
tar -zxvf gromacs-2021.2.tar.gz
```
编译和安装GROMACS
1、进入解压后的源代码目录：
```
cd gromacs-2021.2
```
2、创建一个构建目录并进入：
```
mkdir build
cd build
```
3、使用cmake配置编译选项，这里我们使用openmpi并行计算库，可以提供更好的性能：
```
cmake -DGMX_MPI=ON -DGMX_OPENMP=ON ..
```
4、开始编译：
```
make
```
5、安装GROMACS：
```
sudo make install
```
6、检查安装是否成功，在终端中执行以下命令，如果输出包含“GMX version”信息，则表示安装成功：
```
gmx --version
```
配置环境变量
为了让GROMACS在终端中全局可用，需要配置环境变量，打开~/.bashrc文件，在文件的末尾添加以下内容：
export PATH=$PATH:/usr/local/gromacs/bin export GMXBIN=/usr/local/gromacs/bin export GMXLDLIB=/usr/local/gromacs/lib export GMXMAN=/usr/local/gromacs/share/man export GMXDATA=/usr/local/gromacs/share/gromacs/top
保存并退出文件，然后在终端中执行以下命令使环境变量生效：
source ~/.bashrc
测试GROMACS
1、下载一个示例模拟系统，在终端中执行以下命令：
```
wget http://www.gromacs.orgDownloadsdemosdemo-mdrun.tgz
```
2、解压示例模拟系统：
```
tar -zxvf demo-mdrun.tgz
```
3、进入解压后的示例目录：
```
cd demo-mdrun
```
4、运行模拟：
```
gmx mdrun -v
```
如果模拟正常运行，并且终端中显示相关的日志信息，那么恭喜你，GROMACS已经在openSUSE系统中成功安装并可以使用。
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