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[Linux操作系统]Ubuntu 下安装与使用 Quantum ESPRESSO,开启材料模拟新篇章|,Ubuntu Quantum ESPRESSO,Ubuntu系统下 Quantum ESPRESSO 的安装与实战指南,探索材料模拟新境界

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在Ubuntu操作系统下,安装并使用Quantum ESPRESSO,为材料科学研究开启了新篇章。Quantum ESPRESSO是一款强大的开源软件,专门用于材料模拟和电子结构计算。通过Ubuntu平台,研究人员可以轻松部署该软件,进行原子级别的材料分析和预测,助力材料科学领域的创新研究。

本文目录导读:

  1. Ubuntu系统简介
  2. Quantum ESPRESSO简介
  3. 安装Quantum ESPRESSO
  4. 使用Quantum ESPRESSO

随着科学技术的不断发展,材料科学研究逐渐成为科研领域的一大热点,量子力学作为研究材料性质的基础理论,为科学家们提供了一种深入理解材料内部结构和性质的有效手段,Quantum ESPRESSO是一款基于密度泛函理论(DFT)的开源软件包,它能够进行高效的电子结构和动力学模拟,广泛应用于材料科学、物理、化学等领域,本文将介绍如何在Ubuntu操作系统下安装与使用Quantum ESPRESSO,帮助科研人员开启材料模拟的新篇章。

Ubuntu系统简介

Ubuntu是一款基于Debian的免费开源操作系统,具有稳定性高、安全性好、易用性强等特点,它广泛应用于个人电脑、服务器、云计算等领域,是科研人员常用的操作系统之一。

Quantum ESPRESSO简介

Quantum ESPRESSO是一款基于密度泛函理论的材料模拟软件,由国际上的多个研究团队共同开发,它包含了多种计算模块,如电子结构计算、动力学模拟、结构优化等,可以用于研究材料的电子结构、光学性质、力学性质等。

安装Quantum ESPRESSO

1、安装依赖

在安装Quantum ESPRESSO之前,需要先安装一些依赖库,打开终端,输入以下命令:

sudo apt-get update
sudo apt-get install git gfortran libopenmpi-dev libfftw3-dev liblapack-dev libblas-dev

2、克隆源代码

在安装完依赖库后,使用Git克隆Quantum ESPRESSO的源代码:

git clone https://github.com/QEF/q-e.git
cd q-e

3、编译安装

进入源代码目录,编译安装Quantum ESPRESSO:

make all

编译完成后,会在当前目录下生成一个名为bin的文件夹,里面包含了Quantum ESPRESSO的可执行文件。

使用Quantum ESPRESSO

1、创建输入文件

在使用Quantum ESPRESSO进行计算之前,需要创建输入文件,输入文件包括控制文件、结构文件、伪势文件等,以下是创建输入文件的基本步骤:

(1)控制文件:控制文件用于设置计算参数,如电子结构计算方法、能量收敛标准等,创建一个名为input.in的文本文件,写入以下内容

&control
calculation = 'scf'
restart_mode = 'from_scratch'
/

(2)结构文件:结构文件用于描述晶体结构,创建一个名为input structural.in的文本文件,写入以下内容:

ATOMIC_SPECIES
Si 28.086  Si.pbe-nlcp
ATOMIC_POSITIONS
Si 0.0 0.0 0.0
Si 0.5 0.5 0.5

(3)伪势文件:伪势文件用于描述原子间的相互作用,在Quantum ESPRESSO的源代码目录下,有一个名为pseudo的文件夹,里面包含了多种元素的伪势文件,将所需的伪势文件复制到当前目录下。

2、运行计算

创建好输入文件后,进入Quantum ESPRESSO的bin目录,运行以下命令:

./pw.x < input.in > output.out

input.in为输入文件,output.out为输出文件,计算过程中,可以实时查看输出文件,了解计算进度。

本文介绍了在Ubuntu操作系统下安装与使用Quantum ESPRESSO的方法,通过掌握这款强大的材料模拟软件,科研人员可以更加深入地研究材料性质,为新材料的设计和应用提供理论依据。

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