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本文详细介绍了在Ubuntu操作系统下安装与配置LAMMPS（大规模原子/分子大规模并行模拟器）的步骤，包括必要的依赖安装、编译过程以及环境变量的设置，为科研工作者和开发者提供了Ubuntu LAMMPS搭建的完整教程。
本文目录导读：
LAMMPS（Large-scale Atomic/Molecular Massively Parallel Simulator）是一款广泛用于分子动力学模拟的开源软件，本文将详细介绍如何在Ubuntu操作系统下安装和配置LAMMPS，帮助读者顺利开展分子动力学模拟研究。
安装依赖
在安装LAMMPS之前，需要先安装一些依赖库，打开终端，输入以下命令：
sudo apt-get update sudo apt-get install build-essential libfftw3-dev libmpich-dev libopenmpi-dev
这些命令将安装编译器、FFTW库（用于快速傅里叶变换）、MPICH和OpenMPI（用于并行计算）。
下载LAMMPS源代码
访问LAMMPS官网（https://lammps.sandia.gov/），在“Download”页面找到最新的稳定版本，复制源代码下载链接，然后在终端中使用wget命令下载源代码：
wget https://lammps.sandia.gov/下载链接
下载完成后，解压源代码：
tar -zxvf lammps-版本号.tar.gz
编译LAMMPS
进入解压后的目录，编译LAMMPS：
cd lammps-版本号/src make yes-all make
编译过程中，make命令会根据系统环境自动选择合适的编译器，编译完成后，在src目录下会生成一个名为lammps的执行文件。
配置LAMMPS
1、创建LAMMPS配置文件
在lammps-版本号目录下创建一个名为lammps.config的文件，内容如下：
通用配置 package mpi yes package fft nekrs 并行计算配置 communicate single yes
2、修改环境变量
打开终端，输入以下命令，编辑.bashrc文件：
nano ~/.bashrc
在文件末尾添加以下内容：
export PATH=$PATH:/path/to/lammps-版本号/src export LAMMPS lammps-版本号/src/lammps
将/path/to/lammps-版本号替换为实际路径，保存并退出编辑器。
3、刷新环境变量
在终端输入以下命令，使环境变量生效：
source ~/.bashrc
测试LAMMPS
在终端输入以下命令，运行一个简单的LAMMPS测试：
lammps < in.lj
in.lj是LAMMPS的输入文件，可以在lammps-版本号/examples目录下找到，如果LAMMPS正常运行，终端会输出模拟结果。
本文详细介绍了在Ubuntu操作系统下安装和配置LAMMPS的步骤，通过以上操作，您已经成功安装了LAMMPS，并可以开始进行分子动力学模拟研究。
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本文标签属性：
Ubuntu：ubuntu安装教程
Ubuntu LAMMPS 配置：ubuntu配置mpi
