huanayun
hengtianyun
vps567
莱卡云

[Linux操作系统]openSUSE 系统下 GROMACS 的安装与配置指南|opensuse安装gnome,openSUSE GROMACS 安装,openSUSE系统下GROMACS安装与配置全攻略,一步到位掌握gnome环境搭建

PikPak

推荐阅读:

[AI-人工智能]免翻墙的AI利器:樱桃茶·智域GPT,让你轻松使用ChatGPT和Midjourney - 免费AIGC工具 - 拼车/合租账号 八折优惠码: AIGCJOEDISCOUNT2024

[AI-人工智能]银河录像局: 国内可靠的AI工具与流媒体的合租平台 高效省钱、现号秒发、翻车赔偿、无限续费|95折优惠码: AIGCJOE

[AI-人工智能]免梯免翻墙-ChatGPT拼车站月卡 | 可用GPT4/GPT4o/o1-preview | 会话隔离 | 全网最低价独享体验ChatGPT/Claude会员服务

[AI-人工智能]边界AICHAT - 超级永久终身会员激活 史诗级神器,口碑炸裂!300万人都在用的AI平台

本文介绍了在openSUSE系统下安装与配置GROMACS的详细步骤,包括如何在系统中安装GNOME桌面环境,以及如何顺利安装GROMACS软件,为用户提供了一个高效、稳定的计算环境。

本文目录导读:

  1. 准备工作
  2. 下载 GROMACS 源码
  3. 解压源码
  4. 编译和安装 GROMACS
  5. 配置环境变量
  6. 测试安装
  7. 注意事项

在科学计算领域,GROMACS 是一款广受欢迎的分子动力学模拟软件,它能够帮助科研人员对生物大分子系统进行高效模拟,本文将详细介绍如何在 openSUSE 系统下安装和配置 GROMACS,让读者能够轻松上手。

准备工作

开始安装 GROMACS 之前,首先确保您的 openSUSE 系统已经更新到最新版本,打开终端,执行以下命令:

sudo zypper update

安装编译器和相关依赖包也是必要的,执行以下命令安装编译器和依赖:

sudo zypper install gcc gcc-c++ make automake autoconf libtool

下载 GROMACS 源码

访问 GROMACS 的官方网站(https://www.gromacs.org/),找到最新版本的源码下载链接,将源码包下载到本地,假设我们下载的是gromacs-2021.2.tar.gz

解压源码

在终端中,切换到源码包所在的目录,并执行以下命令解压源码:

tar -zxvf gromacs-2021.2.tar.gz

编译和安装 GROMACS

解压完成后,进入解压后的目录:

cd gromacs-2021.2

配置编译选项:

./configure --prefix=/usr/local/gromacs --enable-mpi

这里我们将 GROMACS 安装到/usr/local/gromacs 目录,并启用 MPI 支持。

配置完成后,执行以下命令编译和安装:

make
sudo make install

配置环境变量

为了让系统能够识别 GROMACS,需要将 GROMACS 的安装路径添加到环境变量中,编辑~/.bashrc 文件,在文件末尾添加以下内容:

export PATH=/usr/local/gromacs/bin:$PATH
export GMXLD_LIBRARY_PATH=/usr/local/gromacs/lib:$GMXLD_LIBRARY_PATH

保存并关闭文件,然后在终端中执行source ~/.bashrc 命令,使环境变量生效。

测试安装

在终端中输入以下命令,检查 GROMACS 是否安装成功:

gmx version

如果看到类似 "GROMACS version 2021.2" 的输出,则表示安装成功。

注意事项

1、安装过程中可能会遇到各种依赖问题,需要根据错误提示逐一解决。

2、如果使用的是 openSUSE Leap 版本,可能需要添加额外的软件源以满足依赖需求。

3、在编译 GROMACS 时,可以根据需要启用或禁用特定的功能。

通过以上步骤,您应该能够在 openSUSE 系统上成功安装和配置 GROMACS,您可以开始使用 GROMACS 进行分子动力学模拟,探索生物大分子的奥秘。

相关关键词:openSUSE, GROMACS, 安装, 配置, 分子动力学, 模拟, 编译, 环境变量, 依赖, 软件源, 版本, 源码, 解压, 终端, 命令, 安装路径, 测试, 注意事项, 功能, 生物大分子, 科学计算, 软件包, 编译器, automake, autoconf, libtool, MPI, bashrc, PATH, GMXLD_LIBRARY_PATH, gmx, version, Leap, 软件源添加, 依赖解决, 模拟研究, 计算机辅助设计, 分子动力学模拟, 生物信息学, 跨平台, 高性能计算, 系统配置, 编译选项, 动态链接库, 系统优化, 计算效率, 并行计算, 模拟工具, 软件安装, 系统集成, 软件开发, 软件维护, 软件更新, 系统管理, 软件兼容性, 系统升级, 系统监控, 系统安全, 系统备份, 系统恢复, 系统优化, 系统维护, 系统性能, 系统扩展, 系统定制, 系统集成, 系统升级, 系统迁移, 系统部署, 系统监控, 系统管理

bwg Vultr justhost.asia racknerd hostkvm pesyun Pawns


本文标签属性:

GROMACS 安装配置:gromacs运行命令

openSUSE GROMACS 安装:opensuse安装常用软件

原文链接:,转发请注明来源!