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本文详细介绍了在openSUSE系统中配置和安装LAMMPS的步骤,包括网络设置和LAMMPS的具体配置方法,旨在帮助用户顺利在openSUSE环境下使用LAMMPS进行分子动力学模拟。
本文目录导读:
LAMMPS(Large-scale Atomic/Molecular Massively Parallel Simulator)是一款强大的分子动力学模拟软件,广泛应用于材料科学、生物物理、化学等领域,本文将详细介绍如何在 openSUSE 系统下配置和安装 LAMMPS。
准备工作
1、确保你的 openSUSE 系统已更新到最新版本,可以使用以下命令进行更新:
sudo zypper refresh sudo zypper update
2、安装必要的编译工具和依赖库:
sudo zypper install git cmake gcc gcc-c++ make libfftw3_3-3-dev
3、创建一个用于编译和安装 LAMMPS 的目录:
mkdir -p ~/lammps && cd ~/lammps
下载 LAMMPS 源代码
1、访问 LAMMPS 官方网站(https://lammps.sandia.gov/)下载最新版本的源代码。
2、将下载的源代码压缩包(lammps-2021-10-22.tar.gz)移动到 ~/lammps 目录下。
3、解压源代码:
tar -zxvf lammps-2021-10-22.tar.gz
4、进入解压后的目录:
cd lammps-2021-10-22
配置 LAMMPS
1、创建一个名为Makefile.openSUSE
的配置文件,用于指定编译选项和依赖库:
cp Makefile.mpi Makefile.openSUSE
2、编辑Makefile.openSUSE
文件,根据你的系统环境进行以下修改:
# 将以下行注释掉 # exporting based on mpiexec from the mpich2 package # MPICC = mpicc # MPICXX = mpicxx # 指定编译器和编译选项 CC = mpicc CXX = mpicxx MPICC = mpicc MPICXX = mpicxx CPPFLAGS = -DLAMMPS_MEMalign=16 -I/usr/include SHFLAGS = -shared -fPIC # 指定 FFTW 库路径 FFTW_INC = -I/usr/include FFTW_LIB = -L/usr/lib64 -lfftw3 # 指定其他依赖库 # ... # 指定安装目录 prefix = /usr/local
3、保存并关闭文件。
编译和安装 LAMMPS
1、编译 LAMMPS:
make yes-styles make
2、安装 LAMMPS:
make install
验证安装
1、运行以下命令,检查 LAMMPS 是否成功安装:
lmp_omp -version
2、如果出现版本信息,则表示 LAMMPS 已成功安装。
本文详细介绍了在 openSUSE 系统下配置和安装 LAMMPS 的过程,通过以上步骤,你可以轻松地在 openSUSE 系统上搭建一个功能强大的分子动力学模拟环境,下面是 50 个中文相关关键词:
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本文标签属性:
配置安装指南:windows安装配置
openSUSE LAMMPS 配置:opensuse ssh