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本文详细介绍了在Ubuntu环境下配置LAMMPS的步骤，包括如何安装和设置MPI支持，旨在帮助用户顺利搭建适用于高性能计算的LAMMPS模拟环境。
本文目录导读：
在科学计算领域，LAMMPS（Large-scale Atomic/Molecular Massively Parallel Simulator）是一款强大的分子动力学模拟软件，本文将为您详细介绍如何在Ubuntu环境下安装和配置LAMMPS，帮助您快速上手这款优秀的模拟工具。
安装依赖
在安装LAMMPS之前，需要确保您的系统中安装了以下依赖：
1、GCC编译器：LAMMPS需要GCC编译器进行编译，可以使用以下命令安装：
sudo apt-get install build-essential
2、MPICH并行库：LAMMAMPS支持并行计算，需要安装MPICH库，使用以下命令安装：
sudo apt-get install mpich
3、其他依赖：LAMMPS还需要一些其他依赖，如BLAS、LAPACK、FFT等，可以使用以下命令安装：
sudo apt-get install libblas-dev liblapack-dev libfftw3-dev
下载LAMMPS源代码
1、访问LAMMPS官方网站（https://lammps.sandia.Gov/），下载最新版本的源代码，将下载的文件保存到本地目录。
2、解压下载的源代码文件：
tar -zxvf lammps-2021-11-11.tar.gz
编译LAMMPS
1、进入解压后的LAMMPS目录：
cd lammps-2021-11-11
2、创建一个构建目录，并进入该目录：
mkdir build && cd build
3、运行以下命令进行编译：
cmake .. make
4、编译完成后，会在build目录下生成lammps可执行文件。
配置LAMMPS
1、创建一个lammps配置文件lammps_input.in，内容如下：
# 模拟盒子大小 dimension 3 boundary p p p units lj atom_style atomic # 初始化原子 lattice fcc 1.0 region box block 0 10 0 10 0 10 create_box 1 box create_atoms 1 box # 设置模拟参数 pair_style lj/cut 2.5 pair_coeff 1 1 1.0 1.0 2.5 # 设置积分器 neighbor 2.5 bin fix 1 all nve # 设置输出 dump 1 all atom 100 dump.lammpstrj thermo 100 run 1000
2、运行LAMMPS：
将配置文件lammps_input.in与lammps可执行文件放在同一目录下，然后在终端中运行以下命令：
./lammps < lammps_input.in
LAMMPS将开始模拟，并生成相应的输出文件。
注意事项
1、LAMMPS的编译选项较多，您可以根据需要选择合适的编译选项，以提高模拟性能。
2、在进行并行计算时，请确保已安装MPICH库，并在运行LAMMPS时使用以下命令：
mpirun -np 4 ./lammps < lammps_input.in
-np 4表示使用4个进程进行并行计算。
3、在使用LAMMPS进行模拟时，请确保输入参数的正确性，否则可能导致模拟结果不准确。
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LAMMPS MPI 配置：lammps安装教程图文
Ubuntu LAMMPS 配置：ubuntu lamp搭建教程
