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本文介绍了在Ubuntu系统下安装与配置GROMACS的详细步骤，包括安装所需的gsl库。通过逐步指导，用户可以顺利完成GROMACS的安装，为分子动力学模拟提供强大的计算支持。
本文目录导读：
GROMACS是一款高性能的分子动力学模拟软件，广泛应用于生物物理、化学、材料科学等领域，在Ubuntu系统中安装GROMACS，可以让我们充分利用Linux系统的强大性能，进行高效的分子动力学模拟，下面将详细介绍在Ubuntu系统下安装GROMACS的步骤。
安装依赖软件
1、安装编译工具
在终端中输入以下命令安装编译工具：
sudo apt-get update sudo apt-get install build-essential
2、安装CMake
CMake是一个跨平台的安装（编译）工具，可以简化GROMACS的安装过程，输入以下命令安装CMake：
sudo apt-get install cmake
3、安装FFTW库
FFTW（The Fastest Fourier Transform in the West）是一个用于计算离散傅里叶变换的库，输入以下命令安装FFTW：
sudo apt-get install fftw3-dev
4、安装其他依赖库
安装以下依赖库，以便在编译GROMACS时使用：
sudo apt-get install libgsl-dev libxml2-dev
下载GROMACS源代码
1、访问GROMACS官方网站（https://www.gromacs.org/），找到最新版本的源代码下载链接。
2、使用wget命令下载源代码：
wget https://ftp.gromacs.org/gromacs/gromacs-2021.2.tar.gz
这里以2021.2版本为例，请根据实际情况选择合适的版本。
编译和安装GROMACS
1、解压源代码：
tar -zxvf gromacs-2021.2.tar.gz
2、进入解压后的文件夹：
cd gromacs-2021.2
3、创建构建目录：
mkdir build cd build
4、使用CMake配置安装目录：
cmake ..
5、编译GROMACS：
make
6、安装GROMACS：
sudo make install
验证安装
1、打开终端，输入以下命令：
gmx --version
如果返回GROMACS的版本信息，则表示安装成功。
2、运行一个简单的测试案例：
gmx mdrun -deffnm test
如果终端显示正常运行的信息，则表示GROMACS安装正确。
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本文标签属性：
GSL安装配置：gs+安装包
Ubuntu GROMACS 安装：ubuntu安装glog
