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[Linux操作系统]openSUSE系统中LAMMPS的详细配置指南|opensuse配置网络,openSUSE LAMMPS 配置

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本文详细介绍如何在OpenSUSE系统中配置LAMMPS。内容涵盖openSUSE网络设置以及LAMMPS的具体安装与配置步骤,旨在帮助用户顺利在openSUSE环境下运行LAMMPS,提升系统性能。

本文目录导读:

  1. 准备工作
  2. 下载LAMMPS源代码
  3. 编译LAMMPS
  4. 配置LAMMPS
  5. 测试LAMMPS

LAMMPS(大规模原子/分子大规模并行模拟器)是一款强大的分子动力学模拟软件,广泛应用于材料科学、生物物理、化学等领域,在openSUSE系统中配置LAMMPS,需要遵循一系列步骤,本文将为您详细介绍在openSUSE系统中安装和配置LAMMPS的过程。

准备工作

1、安装openSUSE系统:确保您的计算机上已经安装了openSUSE系统,如果没有,请参考openSUSE官方网站的安装指南。

2、更新系统:在终端中输入以下命令,确保您的系统是最新的:

```

sudo zypper refresh

sudo zypper update

```

3、安装编译工具:在终端中输入以下命令,安装编译工具和依赖:

```

sudo zypper install gcc gcc-c++ make automake autocOnf libtool

```

下载LAMMPS源代码

1、访问LAMMPS官方网站(https://lammps.sandia.gov/)下载最新版本的源代码,将下载的文件保存到指定目录。

2、解压源代码:

```

tar -zxvf lammps-2021-12-31.tar.gz

```

编译LAMMPS

1、进入解压后的LAMMPS目录:

```

cd lammps-2021-12-31

```

2、创建一个名为“make”的文件夹用于存放编译生成的文件:

```

mkdir make

```

3、编写一个简单的Makefile文件,用于编译LAMMPS,以下是一个示例Makefile:

```

# Makefile for LAMMPS

# Compiler and flags

CC = mpicc

CXX = mpicxx

CPP_FLAGS = -DLAMMPS_MEMAlign=16 -I../src -I../src/langevin -I../src/kspace -I../src/neigh -I../src/pair -I../src/atom -I../src/domain -I../src/molecule -I../src/topology -I../src/comm -I../src/error -I../src/library

LINK_FLAGS = -lm -lpthread

# Source files

SRC = $(wildcard ../src/*.c) $(wildcard ../src/*.cu) $(wildcard ../src/*.f) $(wildcard ../src/*.h)

# Object files

OBJ = $(SRC:.c=.o) $(SRC:.cu=.o) $(SRC:.f=.o)

# Target

TARGET = lmp_omp

# Default rule

all: $(TARGET)

# Compile rule

$(TARGET): $(OBJ)

$(CC) $(CPP_FLAGS) -o $@ $(OBJ) $(LINK_FLAGS)

# Clean rule

clean:

rm -f $(OBJ) $(TARGET)

```

4、在终端中执行以下命令编译LAMMPS:

```

make

```

5、编译成功后,在“make”目录下会生成名为“lmp_omp”的可执行文件。

配置LAMMPS

1、将LAMMPS可执行文件移动到用户主目录:

```

mv make/lmp_omp ~/bin/

```

2、在终端中输入以下命令,将LAMMPS可执行文件的路径添加到环境变量:

```

echo 'export PATH=~/bin:$PATH' >> ~/.bashrc

source ~/.bashrc

```

3、您可以在终端中直接输入“lmp_omp”来运行LAMMPS。

测试LAMMPS

1、在终端中输入以下命令,运行LAMMPS的测试案例:

```

lmp_omp -in in.lj

```

2、如果LAMMPS能够正常运行并输出结果,说明配置成功。

至此,您已经在openSUSE系统中成功配置了LAMMPS,您可以根据需要安装和使用LAMMPS的各种插件和工具。

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openSUSE LAMMPS 配置:opensuse i3wm

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