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[Linux操作系统]openSUSE系统中LAMMPS的安装与配置详解|opensuse i3wm,openSUSE LAMMPS 配置

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本文详细介绍了在openSUSE系统中安装与配置LAMMPS(大规模原子/分子大规模并行模拟器)的步骤,包括在opensuse i3wm环境进行相关操作。内容涵盖安装前环境准备、LAMMPS源码下载、编译安装以及配置过程,旨在帮助用户顺利完成LAMMPS的搭建和使用。

本文目录导读:

  1. openSUSE系统简介
  2. 安装LAMMPS前的准备工作
  3. 下载LAMMPS源代码
  4. 安装LAMMPS
  5. 配置LAMMPS

在科学计算领域,LAMMPS(大规模原子/分子大规模并行模拟器)是一款广泛使用的分子动力学模拟软件,本文将详细介绍在openSUSE系统中安装和配置LAMMPS的步骤,帮助用户更好地利用这一强大的计算工具。

openSUSE系统简介

openSUSE是一款基于Linux内核的自由和开源操作系统,以其稳定性和安全性著称,它提供了丰富的软件包和强大的社区支持,是科学计算的理想选择。

安装LAMMPS前的准备工作

1、更新系统软件包

在安装LAMMPS之前,首先确保openSUSE系统中的软件包是最新的,打开终端,执行以下命令:

sudo zypper refresh
sudo zypper update

2、安装依赖软件包

LAMMPS的安装需要一些依赖软件包,包括CMake、GCC编译器、Python等,可以使用zypper命令安装这些依赖:

sudo zypper install cmake gcc gcc-c++ python3

下载LAMMPS源代码

LAMMPS的源代码可以从其官方网站(https://lammps.sandia.Gov/)下载,在终端中,使用wget命令下载最新版本的LAMMPS源代码:

wget https://lammps.sandia.gov/versions/download/lammps-stable_3Mar2021.tar.gz

安装LAMMPS

1、解压源代码

下载完成后,使用tar命令解压源代码:

tar -xvf lammps-stable_3Mar2021.tar.gz
cd lammps-stable_3Mar2021

2、编译LAMMPS

在解压后的目录中,使用CMake编译LAMMPS,创建一个构建目录:

mkdir build
cd build

运行以下命令编译LAMMPS:

cmake ..
make

编译完成后,LAMMPS的可执行文件将位于src目录下的lmp_serial

3、安装LAMMPS

将LAMMPS的可执行文件移动到系统路径中,以便全局访问:

sudo cp src/lmp_serial /usr/local/bin/

配置LAMMPS

1、设置环境变量

为了方便使用LAMMPS,需要设置环境变量,在.bashrc文件中添加以下内容:

export PATH=$PATH:/usr/local/bin
export LAMMPS_HOME=/path/to/lammps-stable_3Mar2021

/path/to/lammps-stable_3Mar2021为LAMMPS源代码的存放路径,保存并退出文件,然后在终端中运行以下命令使环境变量生效:

source ~/.bashrc

2、测试LAMMPS安装

在终端中运行以下命令,测试LAMMPS是否安装成功:

lmp_serial -help

如果看到LAMMPS的帮助信息,说明安装成功。

本文详细介绍了在openSUSE系统中安装和配置LAMMPS的步骤,通过遵循上述步骤,用户可以顺利安装LAMMPS,并开始进行分子动力学模拟,LAMMPS的强大功能和灵活性使其成为科学研究的重要工具,特别是在材料科学、生物物理等领域。

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