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本文介绍了在Ubuntu系统下安装GROMACS的详细过程，包括安装必要的依赖库GSL（GNU Scientific Library）。步骤涵盖从源代码编译安装GROMACS，确保系统具备编译环境和依赖项，为科研计算提供了高效便捷的解决方案。

本文目录导读：

安装依赖库
下载GROMACS源代码
编译和安装GROMACS
验证安装

GROMACS是一款高性能的分子动力学模拟软件，广泛应用于生物信息学、材料科学和化学等领域，在Ubuntu系统中安装GROMACS，可以让我们更好地进行分子动力学模拟，以下是在Ubuntu系统下安装GROMACS的详细步骤。

安装依赖库

1、更新系统软件包

打开终端，输入以下命令更新系统软件包：

   sudo apt update
   sudo apt upgrade

2、安装编译器和依赖库

GROMACS需要编译器和其他依赖库，使用以下命令安装：

   sudo apt install build-essential cmake git
   sudo apt install libfftw3-dev libgsl-dev libboost-all-dev
   sudo apt install libopenmpi-dev openmpi-bin

下载GROMACS源代码

1、从官方网站下载GROMACS源代码

访问GROMACS官方网站（http://www.gromacs.org/），在“Download”页面找到最新版本的源代码压缩包，将其下载到本地计算机。

2、解压源代码

在终端中，切换到下载目录，使用以下命令解压源代码：

   tar -zxvf gromacs-<version>.tar.gz

其中<version> 为下载的GROMACS版本号。

编译和安装GROMACS

1、切换到解压后的源代码目录

   cd gromacs-<version>

2、创建构建目录

在源代码目录下创建一个名为build 的目录，并切换到该目录：

   mkdir build
   cd build

3、配置编译选项

使用以下命令配置编译选项：

   cmake ..

4、编译GROMACS

使用以下命令编译GROMACS：

   make

5、安装GROMACS

使用以下命令安装GROMACS：

   sudo make install

验证安装

1、打开终端，输入以下命令检查GROMACS版本：

   gmx version

2、如果返回正确的版本信息，则表示GROMACS安装成功。

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本文标签属性：

Ubuntu GROMACS 安装：ubuntu安装gsl

GSL 库安装：glut库安装