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[Linux操作系统]Ubuntu 下 LAMMPS 的安装与配置详解|ubuntu lammps安装教程,Ubuntu LAMMPS 配置,Ubuntu系统下LAMMPS软件的详细安装与配置指南

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本文详细介绍了在Ubuntu操作系统下安装与配置LAMMPS(大规模原子/分子大规模并行模拟器)的步骤。内容涵盖从源代码编译安装到相关依赖库的安装,以及配置LAMMPS的运行环境,为用户提供了全面的Ubuntu LAMMPS安装教程。

本文目录导读:

  1. 安装依赖
  2. 下载LAMMPS源代码
  3. 编译LAMMPS
  4. 配置LAMMPS环境
  5. 测试LAMMPS

LAMMPS(Large-scale AtoMic/Molecular Massively Parallel Simulator)是一款开源的分子动力学模拟软件,广泛应用于材料科学、生物物理、化学等领域,在Ubuntu操作系统下安装和配置LAMMPS,可以让我们充分利用Linux系统的稳定性和高性能,下面将详细介绍在Ubuntu下安装和配置LAMMPS的步骤。

安装依赖

1、安装编译器

在终端中输入以下命令,安装编译器gcc和g++:

sudo apt-get update
sudo apt-get install build-essential

2、安装并行计算库

LAMMPS支持并行计算,因此需要安装MPI(Message Passing Interface)库,在终端中输入以下命令,安装OpenMPI:

sudo apt-get install libopenmpi-dev

3、安装其他依赖库

LAMMPS还需要以下依赖库:libfftw3-dev、libjpeg-dev、libpng-dev,在终端中输入以下命令,安装这些库:

sudo apt-get install libfftw3-dev libjpeg-dev libpng-dev

下载LAMMPS源代码

1、访问LAMMPS官网(https://lammps.sandia.gov/),在“Download”页面下载最新版本的源代码。

2、将下载的文件解压到指定目录,

tar -zxvf lammps-2021-11-10.tar.gz -C /opt/lammps-2021-11-10

编译LAMMPS

1、进入LAMMPS源代码目录:

cd /opt/lammps-2021-11-10/src

2、创建一个名为“makefile”的文件,并输入以下内容:

CC = mpicc
CXX = mpicxx
AR = ar
RANLIB = ranlib
OUTPUT = -O3
DEBUG = -g -DDEBUG
 Precision = -DLAMMPS Grande
package = yes
suffix =

3、编译LAMMPS:

make yes-all
make

4、编译成功后,在“src”目录下会生成一个名为“lmp”的可执行文件。

配置LAMMPS环境

1、在终端中输入以下命令,创建一个名为“lammps”的配置文件

sudo nano /etc/profile.d/lammps.sh

2、在配置文件中输入以下内容:

export LAMMPS_ROOT=/opt/lammps-2021-11-10
export PATH=$PATH:$LAMMPS_ROOT/src

3、保存并退出配置文件。

4、在终端中输入以下命令,使配置文件生效:

source /etc/profile.d/lammps.sh

测试LAMMPS

1、在终端中输入以下命令,运行LAMMPS:

lmp

2、如果出现LAMMPS的命令行界面,则表示安装和配置成功。

至此,我们已经完成了在Ubuntu下安装和配置LAMMPS的步骤,下面是50个与本文相关的中文关键词:

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安装Ubuntu LAMMPS:安装Ubuntu acpi bios error

Ubuntu LAMMPS 配置:ubuntu配置bond4 lacp

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