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本文详细介绍如何在openSUSE系统中安装和配置LAMMPS（大规模原子/分子大规模并行模拟器）。指南涵盖了从系统准备、安装依赖项，到编译和运行LAMMPS的完整步骤，旨在帮助用户在openSUSE环境下顺利部署LAMMPS。
本文目录导读：
LAMMPS（Large-scale AtoMic/Molecular Massively Parallel Simulator）是一款广泛使用的分子动力学模拟软件，支持多种粒子系统的模拟，本文将详细介绍如何在 openSUSE 系统下安装和配置 LAMMPS，帮助用户顺利开展分子动力学模拟工作。
安装编译环境
1、更新系统软件包
确保您的 openSUSE 系统已更新到最新版本，在终端中执行以下命令：
sudo zypper refresh sudo zypper update
2、安装编译器
LAMMPS 需要编译器来编译源代码，在终端中执行以下命令安装编译器：
sudo zypper install gcc gcc-c++ make
3、安装其他依赖库
LAMMPS 还需要一些其他依赖库，如 FFTW、MPI 等，在终端中执行以下命令安装这些依赖库：
sudo zypper install fftw3 fftw3-mpi
下载 LAMMPS 源代码
1、访问 LAMMPS 官方网站（https://lammps.sandia.gov/），下载最新版本的源代码。
2、将下载的源代码压缩包解压到指定目录，例如/home/username/lammps。
编译 LAMMPS
1、进入 LAMMPS 源代码目录：
cd /home/username/lammps/src
2、创建一个名为Makefile 的文件，并写入以下内容：
Compiler flags CC = mpicc CXX = mpicxx FC = mpif90 Compiler optimization flags COPT = -O3 -fopenmp FFTW library flags FFT_INC = -I/usr/include FFT_LIB = -L/usr/lib64 -lfftw3_mpi -lfftw3 MPI library flags MPI_INC = -I/usr/include MPI_LIB = -L/usr/lib64 -lmpi LAMMPS source files SOURCES = $(wildcard *.c) $(wildcard *.cu) $(wildcard *.f) $(wildcard *.h) Object files OBJS = $(SOURCES:.c=.o) $(SOURCES:.cu=.o) $(SOURCES:.f=.o) Executable name EXEC = lmp all: $(EXEC) $(EXEC): $(OBJS) $(CC) $(CXX) $(FC) $(LDFLAGS) -o $(EXEC) $(OBJS) $(FFT_LIB) $(MPI_LIB) clean: rm -f $(OBJS) $(EXEC)
3、编译 LAMMPS：
make
编译完成后，您将在当前目录下看到一个名为lmp 的可执行文件。
运行 LAMMPS
1、创建一个名为in.lammps 的输入文件，写入以下内容：
units metal atom_style atomic boundary p p p lattice fcc 4.05 region box block 0 10 0 10 0 10 create_box 1 box create_atoms 1 box mass 1 63.546 neighbor 2.0 bin neighlist 2.0 bin pair_style lj/cut 2.5 pair_coeff 1 1 1.0 2.5 velocity all create 300 4928459 fix 1 all nve thermo 10 dump 1 all atom 100 dump.lammps run 100
2、运行 LAMMPS：
./lmp -in in.lammps
运行过程中，LAMMPS 将输出模拟结果，您可以通过dump 命令将结果保存到文件中。
本文详细介绍了在 openSUSE 系统下安装和配置 LAMMPS 的过程，通过遵循以上步骤，用户可以顺利安装 LAMMPS 并开展分子动力学模拟，在实际使用过程中，用户还需根据实际需求调整输入文件和参数，以获得更准确的模拟结果。
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