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本文详细介绍了在openSUSE系统中安装与配置LAMMPS(大规模原子/分子大规模并行模拟器)的方法。内容涵盖从系统环境搭建到LAMMPS的编译安装,以及与i3wm桌面环境的兼容性调整,旨在帮助用户高效地在openSUSE平台上使用LAMMPS进行科学计算。
本文目录导读:
LAMMPS(Large-scale AtoMic/Molecular Massively Parallel Simulator)是一款广泛使用的开源分子动力学模拟软件,适用于多种材料的原子尺度模拟,本文将详细介绍如何在openSUSE系统中安装和配置LAMMPS,帮助读者快速上手使用这款强大的模拟工具。
安装前准备
1、确保系统为openSUSE版本,可以通过在终端输入cat /etc/SuSE-release
命令来查看系统版本。
2、更新系统软件包,在终端输入以下命令:
sudo zypper refresh sudo zypper update
3、安装编译工具和依赖库,在终端输入以下命令:
sudo zypper install gcc gcc-c++ make automake autoconf libtool
4、下载LAMMPS源代码,可以从LAMMPS官网(https://lammps.sandia.gov/)下载最新版本的源代码,或者使用以下命令:
wget https://lammps.sandia.gov下载地址
安装LAMMPS
1、解压下载的LAMMPS源代码包,在终端输入以下命令:
tar -xzvf lammps-版本号.tar.gz
2、进入解压后的目录:
cd lammps-版本号
3、编译LAMMPS,在终端输入以下命令:
make
如果需要添加特定的编译选项,可以参考LAMMPS官方文档。
4、安装LAMMPS,在终端输入以下命令:
sudo make install
默认情况下,LAMMPS会安装在/usr/local/lammps
目录下。
配置LAMMPS
1、设置环境变量,在~/.bashrc
文件中添加以下内容:
export PATH=/usr/local/lammps:$PATH export LD_LIBRARY_PATH=/usr/local/lammps/lib:$LD_LIBRARY_PATH
保存并退出编辑器,然后在终端输入以下命令使环境变量生效:
source ~/.bashrc
2、验证LAMMPS安装,在终端输入以下命令:
lmp_serial -help
如果看到LAMMPS的帮助信息,则表示安装成功。
使用LAMMPS
1、创建模拟脚本,可以使用文本编辑器编写LAMMPS的输入脚本,例如in.lammps
。
2、运行LAMMPS,在终端输入以下命令:
lmp_serial -in in.lammps
LAMMPS将根据输入脚本进行模拟计算。
3、查看模拟结果,在LAMMPS运行结束后,可以查看生成的日志文件、数据文件等,以分析模拟结果。
本文详细介绍了在openSUSE系统中安装和配置LAMMPS的过程,希望对读者有所帮助,通过使用LAMMPS,您可以开展各种原子尺度模拟研究,为材料科学、生物物理等领域提供有力的支持。
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本文标签属性:
i3wm 环境配置:i3 networkmanager
openSUSE LAMMPS 配置:opensuse15.3