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本文介绍了在opENSUSE系统中配置LAMMPS的详细步骤,包括openSUSE系统的网络设置及LAMMPS的安装与配置。通过本文,用户可以快速掌握在openSUSE环境下搭建LAMMPS的方法。
本文目录导读:
LAMMPS(大规模原子/分子大规模并行模拟器)是一款广泛使用的开源分子动力学模拟软件,本文将详细介绍在 openSUSE 系统下如何安装和配置 LAMMPS,帮助读者快速上手。
openSUSE 系统准备
1、更新系统
在开始安装 LAMMPS 之前,首先确保您的 openSUSE 系统是最新的,打开终端,输入以下命令:
sudo zypper update
2、安装编译工具
LAMMPS 需要编译安装,因此需要安装编译工具,输入以下命令安装编译器:
sudo zypper install gcc gcc-c++ make
安装 LAMMPS
1、下载 LAMMPS 源码
访问 LAMMPS 官方网站(https://lammps.sandia.gov/)下载最新版本的源码,将下载的源码文件解压到指定目录。
2、编译 LAMMPS
打开终端,进入 LAMMPS 源码目录,执行以下命令:
make yes-all make
编译过程可能需要一段时间,耐心等待,编译完成后,在目录中会生成一个名为lmp
的可执行文件。
3、运行 LAMMPS
在终端中,进入 LAMMPS 源码目录,运行以下命令:
./lmp
如果系统提示找不到命令,请将lmp
的路径添加到环境变量中。
配置 LAMMPS
1、修改参数文件
LAMMPS 的参数文件通常以.in
为后缀,在运行 LAMMPS 之前,需要根据实际需求修改参数文件,以下是一个简单的参数文件示例:
units metal dimension 3 boundary p p p atom_style atom
2、使用 Python 脚本
LAMMPS 支持使用 Python 脚本来进行参数设置和结果分析,以下是一个简单的 Python 脚本示例:
import lammps lmp = lammps.lammps() lmp.command("units metal") lmp.command("dimension 3") lmp.command("boundary p p p") lmp.command("atom_style atom")
3、运行 LAMMPS
修改完参数文件或编写完 Python 脚本后,运行 LAMMPS:
./lmp -in in.lammps
或者使用 Python 脚本:
lmp.run(0)
LAMMPS 插件安装
LAMMPS 支持多种插件,以扩展其功能,以下是一些常用插件的安装方法:
1、安装插件源码
从 LAMMPS 官方网站下载插件源码,解压到 LAMMPS 源码目录下的src
目录中。
2、编译插件
在 LAMMPS 源码目录下,执行以下命令:
make yes-<plugin_name> make
其中<plugin_name>
是插件的名称。
3、使用插件
在 LAMMPS 参数文件或 Python 脚本中,加载插件:
package <plugin_name>
或者:
lmp.command("package <plugin_name>")
本文详细介绍了在 openSUSE 系统下安装和配置 LAMMPS 的过程,通过遵循以上步骤,您可以轻松地在 openSUSE 系统上搭建起 LAMMPS 模拟环境,开展分子动力学模拟研究。
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LAMMPS配置:lammps安装教程图文
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