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[Linux操作系统]openSUSE系统中LAMMPS的详细配置指南|opensuse配置网络,openSUSE LAMMPS 配置,openSUSE系统下LAMMPS配置与网络设置完整指南

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本文详细介绍在openSUSE系统中配置LAMMPS的步骤,包括openSUSE系统的网络设置以及LAMMPS的安装与优化。内容涵盖从系统环境准备到LAMMPS编译运行的完整过程,为用户提供了详尽的指南。

本文目录导读:

  1. 系统要求
  2. 安装依赖
  3. 下载LAMMPS源代码
  4. 编译LAMMPS
  5. 配置LAMMPS
  6. LAMMPS使用技巧

LAMMPS(Large-scale Atomic/Molecular Massively Parallel Simulator)是一款强大的分子动力学模拟软件,广泛应用于材料科学、生物物理、化学等领域,本文将详细介绍如何在openSUSE系统中安装和配置LAMMPS,帮助读者快速上手。

系统要求

在安装LAMMPS之前,请确保您的openSUSE系统满足以下要求:

1、操作系统:openSUSE Leap 15.2 或更高版本。

2、编译器:GCC 4.8 或更高版本。

3、数学库:BLAS和LAPACK库。

4、Python:Python 3.x(建议使用Python 3.6或更高版本)。

安装依赖

1、安装编译器和数学库:

sudo zypper install gcc gcc-c++ gcc-fortran lapack blas

2、安装Python:

sudo zypper install python3 python3-numpy python3-scipy

3、安装其他依赖:

sudo zypper install git cmake

下载LAMMPS源代码

1、访问LAMMPS官方网站(https://lammps.sandia.gov/)下载最新版本的源代码。

2、将下载的源代码包解压到指定目录:

tar -zxvf lammps-2021-11-15.tar.gz -C /path/to/installation/directory

编译LAMMPS

1、进入LAMMPS源代码目录:

cd /path/to/installation/directory/lammps-2021-11-15/src

2、创建一个构建目录:

mkdir build && cd build

3、使用CMake配置编译选项:

cmake ..

4、编译LAMMPS:

make -j $(nproc)

5、编译完成后,将生成的可执行文件lammps迁移到安装目录:

sudo cp lmp_.. /path/to/installation/directory/bin

配置LAMMPS

1、创建一个lammps输入文件:

touch lammps_input.in

2、编辑输入文件,添加以下内容:

units metal
atom_style atomic
boundary p p p
 lattice fcc 4.05
region box block 0 10 0 10 0 10
create_box 1 box
create_atoms 1 box
mass 1 63.5
neighbor 2.0 bin
neigh_modify delay 0 every 1 check yes
velocity all create 300 123456
fix 1 all nve
dump 1 all atom 10 dump.lammpstrj
run 100

3、运行LAMMPS:

/path/to/installation/directory/bin/lmp_.. -in lammps_input.in

LAMMPS使用技巧

1、查看LAMMPS版本信息:

/path/to/installation/directory/bin/lmp_.. -version

2、查看LAMMPS支持的命令:

/path/to/installation/directory/bin/lmp_.. -help

3、查看LAMMPS的并行性能:

/path/to/installation/directory/bin/lmp_.. -bench

本文详细介绍了在openSUSE系统中安装和配置LAMMPS的步骤,希望对读者有所帮助,通过掌握LAMMPS的基本操作,您可以开展一系列分子动力学模拟研究,为科学研究和工程应用提供有力支持。

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