huanayun
hengtianyun
vps567
莱卡云

[Linux操作系统]Ubuntu 下 LAMMPS 的详细配置指南|ubuntu lamp搭建教程,Ubuntu LAMMPS 配置,Ubuntu系统下LAMMPS安装与配置全攻略,从入门到精通

PikPak

推荐阅读:

[AI-人工智能]免翻墙的AI利器:樱桃茶·智域GPT,让你轻松使用ChatGPT和Midjourney - 免费AIGC工具 - 拼车/合租账号 八折优惠码: AIGCJOEDISCOUNT2024

[AI-人工智能]银河录像局: 国内可靠的AI工具与流媒体的合租平台 高效省钱、现号秒发、翻车赔偿、无限续费|95折优惠码: AIGCJOE

[AI-人工智能]免梯免翻墙-ChatGPT拼车站月卡 | 可用GPT4/GPT4o/o1-preview | 会话隔离 | 全网最低价独享体验ChatGPT/Claude会员服务

[AI-人工智能]边界AICHAT - 超级永久终身会员激活 史诗级神器,口碑炸裂!300万人都在用的AI平台

本文详细介绍了在Ubuntu操作系统下如何配置LAMMPS(大规模原子/分子大规模并行模拟器)。指南涵盖了从安装必要的依赖库到编译和测试LAMMPS的完整步骤,旨在帮助用户高效搭建LAMMPS环境,为科研和工程模拟提供便捷工具。

本文目录导读:

  1. 安装依赖库
  2. 下载LAMMPS源代码
  3. 编译LAMMPS
  4. 配置LAMMPS
  5. 运行LAMMPS模拟
  6. 注意事项

LAMMPS(Large-scale AtoMic/Molecular Massively Parallel Simulator)是一款广泛使用的分子动力学模拟软件,支持多种材料的建模与模拟,在Ubuntu操作系统下配置LAMMPS,虽然过程较为繁琐,但只要按照以下步骤进行,便可以顺利完成,本文将详细介绍在Ubuntu下配置LAMMPS的整个过程。

安装依赖库

在安装LAMMPS之前,需要先安装一些依赖库,打开终端,输入以下命令:

sudo apt-get update
sudo apt-get install build-essential
sudo apt-get install libfftw3-dev
sudo apt-get install libmpich-dev
sudo apt-get install libgsl-dev
sudo apt-get install libopenmpi-dev

下载LAMMPS源代码

访问LAMMPS官方网站(https://lammps.sandia.gov/)下载最新版本的源代码,将下载好的文件解压到指定目录。

编译LAMMPS

1、进入LAMMPS源代码目录,创建一个名为“build”的文件夹:

mkdir build
cd build

2、编译LAMMPS:

cmake ..
make

编译完成后,在“build”目录下会生成一个名为“lmp”的可执行文件。

配置LAMMPS

1、创建一个新的文件夹用于存放LAMMPS的配置文件

mkdir lammps_config
cd lammps_config

2、创建一个名为“lammps.in”的配置文件,并输入以下内容:

package        mpi yes
units          metal
atom_style     atomic
boundary       p p p
neighbor       2.0 bin
neigh_list     cut bond
special_bonds  lj/coul 0.0 1.0 1.0

3、在终端中运行以下命令,将配置文件与LAMMPS可执行文件关联:

mpirun -np 4 ~/path/to/lammps/build/lmp -in lammps.in

“-np 4”表示使用4个进程进行计算,可以根据自己的计算机性能调整。

运行LAMMPS模拟

1、创建一个名为“data.in”的输入文件,输入以下内容:

LAMMPS data file created by atomsk
#Simulation Box
2、0 2.0 2.0 xlo xhi
2、0 2.0 2.0 ylo yhi
2、0 2.0 2.0 zlo zhi
#Number of atoms
100 atoms
#Atom types
1 atom types
#Masses
1 1.0
#Atoms
1 1 1 0.5 0.5 0.5
...

2、在终端中运行以下命令,开始模拟:

mpirun -np 4 ~/path/to/lammps/build/lmp -in data.in

注意事项

1、确保安装了所有依赖库,否则编译过程中可能会出现错误。

2、根据自己的计算机性能,合理调整进程数。

3、LAMMPS的输入文件需要根据实际模拟的体系进行调整。

4、如果在编译过程中遇到问题,可以查阅LAMMPS官方文档或向社区寻求帮助。

以下为50个中文相关关键词:

Ubuntu, LAMMPS, 配置, 模拟, 编译, 依赖库, 输入文件, 输出文件, 进程, 性能, 数据, 模型, 计算机性能, 调整, 文件夹, 终端, 命令, 官方网站, 下载, 源代码, 创建, 运行, 模拟体系, 文档, 社区, 帮助, 安装, 更新, 库, 编译器, 参数, 调试, 错误, 优化, 效率, 计算, 分子动力学, 原子, 晶体, 结构, 势函数, 相互作用, 力场, 热力学, 动力学, 配位数, 粒子, 颗粒

bwg Vultr justhost.asia racknerd hostkvm pesyun Pawns


本文标签属性:

配置指南:dhcpsnooping配置指南

Ubuntu LAMMPS 配置:ubuntu配置pcl

原文链接:,转发请注明来源!