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本文详细介绍了在Ubuntu操作系统下安装与配置LAMMPS（大规模原子/分子大规模并行模拟器）的方法，包括如何安装必要的依赖包、配置MPI环境以及编译安装LAMMPS。通过逐步指导，帮助用户顺利完成安装和配置，以支持高性能计算需求。

本文目录导读：

安装依赖
下载 LAMMPS 源代码
编译 LAMMPS
配置 LAMMPS
运行 LAMMPS

在科研和工程领域，分子动力学模拟是一种重要的研究方法，LAMMPS（Large-scale Atomic/Molecular Massively Parallel Simulator）是一款高性能的分子动力学模拟软件，广泛应用于材料科学、生物物理、化学等领域，本文将详细介绍如何在 Ubuntu 系统下安装和配置 LAMMPS。

安装依赖

在安装 LAMMPS 之前，需要先安装一些依赖库，打开终端，输入以下命令：

sudo apt-get update
sudo apt-get install build-essential
sudo apt-get install libfftw3-dev
sudo apt-get install libmpich-dev mpich
sudo apt-get install libgsl-dev

这些命令将安装编译器、FFTW（快速傅里叶变换库）、MPI（消息传递接口库）和 GSL（GNU 科学库）等依赖库。

下载 LAMMPS 源代码

前往 LAMMPS 官方网站（https://lammps.sandia.gov/）下载最新版本的源代码，将下载好的源代码压缩包解压到指定文件夹。

编译 LAMMPS

在解压后的文件夹中，打开终端，执行以下命令：

cd lammps-<version>  # 替换 <version> 为实际版本号
make yes-mpich       # 使用 MPI 编译
make

编译完成后，会在文件夹中生成一个名为lmp_ubuntu 的可执行文件。

配置 LAMMPS

1、设置环境变量

在终端中输入以下命令，打开~/.bashrc 文件：

gedit ~/.bashrc

在文件末尾添加以下内容：

export PATH=$PATH:/path/to/lammps/lammps-<version>/src
export LAMMPS_PATH=/path/to/lammps/lammps-<version>/src

将/path/to/lammps/lammps-<version>/src 替换为 LAMMPS 源代码所在路径，保存并关闭文件。

2、设置 LAMMPS 参数

在终端中输入以下命令，打开lammps.in 文件：

gedit /path/to/lammps/lammps-<version>/src/lammps.in

根据实际需求，修改文件中的参数，如模拟盒尺寸、粒子类型、相互作用势等，保存并关闭文件。

运行 LAMMPS

在终端中输入以下命令，运行 LAMMPS：

lmp_ubuntu -in /path/to/lammps/lammps-<version>/src/lammps.in

LAMMPS 将开始运行，根据设置的参数进行分子动力学模拟。

本文详细介绍了在 Ubuntu 系统下安装和配置 LAMMPS 的过程，通过以上步骤，用户可以顺利地在 Ubuntu 系统上搭建一个 LAMMPS 模拟环境，为科研和工程应用提供有力支持。

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本文标签属性：

MPI 配置：mpd配置

Ubuntu LAMMPS 配置：ubuntu配置pcl