huanayun
hengtianyun
vps567
莱卡云

[Linux操作系统]Ubuntu系统下GROMACS的安装与配置指南|ubuntu18安装gromacs,Ubuntu GROMACS 安装,Ubuntu 18.04下GROMACS安装与配置全攻略,详细步骤解析

PikPak

推荐阅读:

[AI-人工智能]免翻墙的AI利器:樱桃茶·智域GPT,让你轻松使用ChatGPT和Midjourney - 免费AIGC工具 - 拼车/合租账号 八折优惠码: AIGCJOEDISCOUNT2024

[AI-人工智能]银河录像局: 国内可靠的AI工具与流媒体的合租平台 高效省钱、现号秒发、翻车赔偿、无限续费|95折优惠码: AIGCJOE

[AI-人工智能]免梯免翻墙-ChatGPT拼车站月卡 | 可用GPT4/GPT4o/o1-preview | 会话隔离 | 全网最低价独享体验ChatGPT/Claude会员服务

[AI-人工智能]边界AICHAT - 超级永久终身会员激活 史诗级神器,口碑炸裂!300万人都在用的AI平台

本文详细介绍了在Ubuntu系统下安装与配置GROMACS的方法,以Ubuntu 18版本为例,步骤包括安装依赖包、下载GROMACS源码、编译安装以及环境变量的配置,为用户提供了清晰的安装指南。

本文目录导读:

  1. 安装前的准备工作
  2. 下载GROMACS源代码
  3. 编译安装GROMACS
  4. 配置环境变量
  5. 测试安装
  6. 注意事项

GROMACS是一款高性能的分子动力学模拟软件,广泛应用于生物物理、化学、材料科学等领域,在Ubuntu系统下安装GROMACS,可以充分利用其强大的计算能力,以下是在Ubuntu系统上安装GROMACS的详细步骤。

安装前的准备工作

1、更新系统

确保你的Ubuntu系统是最新的,打开终端,输入以下命令:

sudo apt update
sudo apt upgrade

2、安装依赖

GROMACS安装过程中需要一些依赖库,可以使用以下命令安装:

sudo apt install cmake gfortran libfftw3-3 libfftw3-dev libopenmpi-dev openmpi-bin

下载GROMACS源代码

1、访问GROMACS官网(https://www.gromacs.org/),找到最新版本的源代码。

2、将源代码下载到本地,可以使用wget命令:

wget https://ftp.gromacs.org/gromacs/gromacs-2021.2.tar.gz

这里以2021.2版本为例,请根据实际情况选择合适的版本。

编译安装GROMACS

1、解压源代码:

tar -zxvf gromacs-2021.2.tar.gz

2、进入解压后的目录:

cd gromacs-2021.2

3、创建一个构建目录:

mkdir build && cd build

4、使用CMake配置编译选项:

cmake ..

5、开始编译:

make

6、安装GROMACS:

sudo make install

配置环境变量

为了方便使用GROMACS,需要将其添加到环境变量中,打开终端,输入以下命令:

echo 'export PATH=$PATH:/usr/local/gromacs/bin' >> ~/.bashrc
source ~/.bashrc

测试安装

在终端输入以下命令,查看GROMACS版本:

gmx --version

如果返回了正确的版本信息,那么恭喜你,GROMACS安装成功!

注意事项

1、在编译过程中,可能会遇到一些错误,根据错误信息,安装缺失的依赖库,重新编译。

2、如果你的计算机性能较好,可以使用多线程编译,提高编译速度,使用以下命令:

make -j 4

4表示同时使用4个线程编译。

3、安装完成后,建议使用最新的GROMACS版本,以获得最佳性能和功能。

以下是50个中文相关关键词:

Ubuntu, GROMACS, 安装, 分子动力学, 模拟, 生物物理, 化学, 材料科学, 依赖库, 源代码, 编译, 环境变量, 配置, 测试, 版本, 错误, 依赖, 多线程, 性能, 更新, 系统维护, 软件安装, 软件包, 指南, 操作步骤, 安装过程, 编译选项, 安装路径, 系统配置, 计算机性能, 编译速度, 线程数, 功能, 性能优化, 最新版本, 官网, 下载, 解压, 构建目录, 环境变量配置, 测试命令, 版本信息, 注意事项, 错误处理, 多线程编译, 安装完成, 使用建议

bwg Vultr justhost.asia racknerd hostkvm pesyun Pawns


本文标签属性:

安装配置指南:安装和配置

Ubuntu GROMACS 安装:ubuntu18安装gromacs

原文链接:,转发请注明来源!