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本文详细介绍了在openSUSE系统下如何配置网络并安装LAMMPS。指南涵盖从系统环境准备到LAMMPS的编译与安装,为用户提供了全面的步骤解析,助力高效完成配置工作。
本文目录导读:
LAMMPS(大规模原子/分子大规模并行模拟器)是一款强大的分子动力学模拟软件,广泛应用于物理、化学、材料科学等领域,本文将以openSUSE操作系统为例,详细介绍LAMMPS的配置与安装过程。
openSUSE系统准备
1、更新系统软件包
在开始安装LAMMPS之前,首先确保openSUSE系统已更新到最新版本,打开终端,执行以下命令:
sudo zypper refresh sudo zypper update
2、安装编译工具
LAMMPS需要编译安装,因此需要安装编译工具,执行以下命令安装:
sudo zypper install gcc gcc-c++ make
下载LAMMPS源码
1、访问LAMMPS官网(https://lammps.sandia.gov/),在“Download”页面找到源码下载链接。
2、将源码包下载到openSUSE系统,可以使用wget命令,如下:
wget https://lammps.sandia.gov下载链接
编译LAMMPS
1、解压源码包
在终端中,切换到源码包所在目录,解压源码包:
tar -zxvf lammps-版本号.tar.gz
2、编译LAMMPS
切换到解压后的lammps目录,执行以下命令编译:
make serial
这里使用的是默认的serial(串行)版本,如果需要编译并行版本,可以使用以下命令:
make mpi
编译完成后,在lammps目录下会生成可执行文件lammps_serial或lammps_mpi。
配置LAMMPS
1、创建配置文件
在lammps目录下,创建一个名为lammps.in的配置文件,文件内容如下:
package mpi yes neighbor 2.0 bin neighlistBIN neighlistMULTI 10000 10000.0 bin comm门槛 2.0
2、运行LAMMPS
在终端中,运行以下命令启动LAMMPS:
./lammps_serial -in lammps.in
或者(如果是并行版本):
./lammps_mpi -in lammps.in
LAMMPS使用示例
以下是一个简单的LAMMPS使用示例,用于模拟 LJ 液体的蒸发过程:
1、创建输入文件
在lammps目录下,创建一个名为lmps_input的输入文件,文件内容如下:
units lj atom_style atomic boundary p p p lattice lj 1.0 region box block 0 10 0 10 0 10 create_box 1 box create_atoms 1 box mass 1 1.0 pair_style lj/cut 2.5 pair_coeff 1 1 1.0 1.0 2.5 velocity all create 1.0 49287 loop yes thermo 100 dump id atom 100 dump.id run 1000
2、运行LAMMPS
在终端中,运行以下命令:
./lammps_serial -in lmps_input
或者(如果是并行版本):
./lammps_mpi -in lmps_input
LAMMPS将开始模拟,并在每100步输出一次模拟结果。
关键词:
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本文标签属性:
配置安装指南:安装配置文件在哪
openSUSE LAMMPS 配置:opensuse 15.2