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[Linux操作系统]openSUSE系统下LAMMPS的配置与安装指南|opensuse配置网络,openSUSE LAMMPS 配置,手把手教程,openSUSE系统下LAMMPS的详细配置与安装步骤

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本文详细介绍了在openSUSE系统下如何配置网络并安装LAMMPS。指南涵盖从系统环境准备到LAMMPS的编译与安装,为用户提供了全面的步骤解析,助力高效完成配置工作。

本文目录导读:

  1. openSUSE系统准备
  2. 下载LAMMPS源码
  3. 编译LAMMPS
  4. 配置LAMMPS
  5. LAMMPS使用示例

LAMMPS(大规模原子/分子大规模并行模拟器)是一款强大的分子动力学模拟软件,广泛应用于物理、化学、材料科学等领域,本文将以openSUSE操作系统为例,详细介绍LAMMPS的配置与安装过程。

openSUSE系统准备

1、更新系统软件包

开始安装LAMMPS之前,首先确保openSUSE系统已更新到最新版本,打开终端,执行以下命令:

sudo zypper refresh
sudo zypper update

2、安装编译工具

LAMMPS需要编译安装,因此需要安装编译工具,执行以下命令安装:

sudo zypper install gcc gcc-c++ make

下载LAMMPS源码

1、访问LAMMPS官网(https://lammps.sandia.gov/),在“Download”页面找到源码下载链接。

2、将源码包下载到openSUSE系统,可以使用wget命令,如下:

wget https://lammps.sandia.gov下载链接

编译LAMMPS

1、解压源码包

在终端中,切换到源码包所在目录,解压源码包:

tar -zxvf lammps-版本号.tar.gz

2、编译LAMMPS

切换到解压后的lammps目录,执行以下命令编译:

make serial

这里使用的是默认的serial(串行)版本,如果需要编译并行版本,可以使用以下命令:

make mpi

编译完成后,在lammps目录下会生成可执行文件lammps_serial或lammps_mpi。

配置LAMMPS

1、创建配置文件

在lammps目录下,创建一个名为lammps.in的配置文件,文件内容如下:

package	mpi yes
neighbor	2.0 bin
neighlistBIN
neighlistMULTI 10000 10000.0 bin
comm门槛 2.0

2、运行LAMMPS

在终端中,运行以下命令启动LAMMPS:

./lammps_serial -in lammps.in

或者(如果是并行版本):

./lammps_mpi -in lammps.in

LAMMPS使用示例

以下是一个简单的LAMMPS使用示例,用于模拟 LJ 液体的蒸发过程:

1、创建输入文件

在lammps目录下,创建一个名为lmps_input的输入文件,文件内容如下:

units	lj
atom_style atomic
boundary	p p p
lattice	lj 1.0
region	box block 0 10 0 10 0 10
create_box	1 box
create_atoms	1 box
mass	1 1.0
pair_style	lj/cut 2.5
pair_coeff	1 1 1.0 1.0 2.5
velocity	all create 1.0 49287 loop yes
thermo	100
dump	id atom 100 dump.id
run	1000

2、运行LAMMPS

在终端中,运行以下命令:

./lammps_serial -in lmps_input

或者(如果是并行版本):

./lammps_mpi -in lmps_input

LAMMPS将开始模拟,并在每100步输出一次模拟结果。

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本文标签属性:

配置安装指南:安装配置文件在哪

openSUSE LAMMPS 配置:opensuse 15.2

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