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[Linux操作系统]openSUSE 与 Quantum ESPRESSO,打造高效的科学计算环境|,openSUSE Quantum ESPRESSO,openSUSE + Quantum ESPRESSO,构建高性能Linux科学计算平台

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本文介绍了如何利用openSUSE操作系统与Quantum ESPRESSO软件,构建一个高效的科学计算环境。openSUSE的稳定性和高性能特点,结合Quantum ESPRESSO的计算能力,为科研工作者提供了强大的工具,助力其在材料科学、物理等领域取得突破。

本文目录导读:

  1. openSUSE 简介
  2. Quantum ESPRESSO 简介

在科学计算领域,Linux 操作系统因其稳定性和强大的计算能力而备受青睐,openSUSE 作为一款优秀的开源 Linux 发行版,为科研人员提供了稳定、灵活的计算平台,而 Quantum ESPRESSO 则是一款功能强大的开源量子力学计算软件,广泛应用于材料科学、物理、化学等领域,本文将介绍如何利用 openSUSE 搭建一个高效的科学计算环境,并重点探讨 Quantum ESPRESSO 在此环境中的应用。

openSUSE 简介

openSUSE 是一款基于 SUSE Linux Enterprise 的开源操作系统,旨在为用户提供一个稳定、安全、易用的计算平台,openSUSE 支持多种硬件平台,包括 x86、ARM、PowerPC 等,具有强大的软件仓库和社区支持,openSUSE 提供了两种版本:Leap 和 Tumbleweed,Leap 版本注重稳定性和兼容性,适合企业级用户;Tumbleweed 版本则采用滚动更新,适合追求最新技术的用户。

Quantum ESPRESSO 简介

Quantum ESPRESSO 是一款基于密度泛函理论(DFT)的量子力学计算软件,可用于计算材料的电子结构、动力学性质、光学性质等,Quantum ESPRESSO 拥有丰富的功能模块,包括 PWscf、Phonopy、Questaal 等,支持多种计算方法,如平面波方法、赝势方法等,Quantum ESPRESSO 的开源特性使其在科研领域得到了广泛应用。

三、openSUSE 与 Quantum ESPRESSO 的结合

1、安装 openSUSE

我们需要在计算节点上安装 openSUSE,可以从 openSUSE 官方网站下载 Leap 或 Tumbleweed 版本的 ISO 镜像,使用 USB 刻录工具将 ISO 镜像写入 U 盘,然后通过 U 盘启动计算机,进入安装界面,根据提示完成安装过程。

2、配置计算环境

在 openSUSE 系统中,我们需要配置计算环境,包括安装编译器、数学库、并行计算工具等,以下是一些常用的配置步骤:

(1)安装编译器:使用以下命令安装 GCC 编译器:

sudo zypper install gcc gcc-c++ make

(2)安装数学库:安装以下数学库以支持量子计算:

sudo zypper install lapack blas fftw3

(3)安装并行计算工具:安装以下并行计算工具以支持高性能计算:

sudo zypper install openmpi

3、安装 Quantum ESPRESSO

在配置好计算环境后,我们可以安装 Quantum ESPRESSO,以下是一个简单的安装步骤:

(1)从 Quantum ESPRESSO 官方网站下载源代码压缩包。

(2)解压源代码包,进入解压后的目录。

(3)编译安装 Quantum ESPRESSO:

make all
sudo make install

4、使用 Quantum ESPRESSO 进行计算

安装完成后,我们可以使用 Quantum ESPRESSO 进行计算,以下是一个简单的计算示例:

(1)创建一个名为 input.in 的输入文件,写入以下内容:

&control
calculation = 'scf'
/
&system
ibrav = 2
celldm(1) = 10.0
nat = 2
ntyp = 1
/
&electrons
conv_thr = 1.0d-6
/
ATOMIC_SPECIES
Si 28.086  Si.pbe-n-rrkjus_psl.0.2.UPF
ATOMIC_POSITIONS
Si 0.0 0.0 0.0
Si 2.5 2.5 2.5
K_POINTS
 Monkhorst-Pack 4 4 4
/

(2)运行 Quantum ESPRESSO:

mpirun -np 4 pw.x < input.in > output.out

mpirun 是并行计算工具,-np 4 表示使用 4 个进程进行计算。

openSUSE 与 Quantum ESPRESSO 的结合,为科研人员提供了一个高效、稳定的科学计算环境,通过本文的介绍,我们了解了如何在 openSUSE 系统中安装和配置 Quantum ESPRESSO,以及如何使用该软件进行计算,借助这一环境,科研人员可以更好地开展量子力学计算研究,为我国材料科学、物理、化学等领域的发展贡献力量

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openSUSE:openSUSE MicroOS

Quantum ESPRESSO:Quantum ESPRESSO教程

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