推荐阅读:
[AI-人工智能]免翻墙的AI利器:樱桃茶·智域GPT,让你轻松使用ChatGPT和Midjourney - 免费AIGC工具 - 拼车/合租账号 八折优惠码: AIGCJOEDISCOUNT2024
[AI-人工智能]银河录像局: 国内可靠的AI工具与流媒体的合租平台 高效省钱、现号秒发、翻车赔偿、无限续费|95折优惠码: AIGCJOE
[AI-人工智能]免梯免翻墙-ChatGPT拼车站月卡 | 可用GPT4/GPT4o/o1-preview | 会话隔离 | 全网最低价独享体验ChatGPT/Claude会员服务
[AI-人工智能]边界AICHAT - 超级永久终身会员激活 史诗级神器,口碑炸裂!300万人都在用的AI平台
本文详细介绍了在openSUSE系统中安装与配置LAMMPS(大规模原子/分子大规模并行模拟器)的步骤,包括系统环境的准备、LAMMPS的编译安装以及相关依赖库的配置,旨在帮助用户顺利在openSUSE平台上使用LAMMPS进行高效计算模拟。
本文目录导读:
LAMMPS(Large-scale Atomic/Molecular Massively Parallel Simulator)是一款强大的分子动力学模拟软件,广泛应用于材料科学、生物物理、化学等领域,本文将详细介绍如何在openSUSE系统中安装和配置LAMMPS,帮助读者顺利搭建起自己的分子动力学模拟环境。
系统要求
在开始安装LAMMPS之前,请确保您的openSUSE系统满足以下要求:
1、操作系统:openSUSE Leap 15.2 或更高版本。
2、CPU:64位处理器。
3、内存:至少4GB,建议使用更高配置。
4、硬盘:至少20GB空闲空间。
安装依赖
LAMMPS依赖于一些外部库和工具,因此在安装LAMMPS之前,需要先安装以下依赖:
1、CMake:用于构建LAMMPS的编译工具。
2、GCC:编译器,用于编译LAMMPS源代码。
3、MPICH:并行计算库,用于支持LAMMPS的并行计算功能。
在openSUSE系统中,可以使用以下命令安装这些依赖:
sudo zypper install cmake gcc mpich
下载LAMMPS源代码
访问LAMMPS官方网站(https://lammps.sandia.gov/),下载最新版本的LAMMPS源代码,将下载的文件保存到您的openSUSE系统中。
编译LAMMPS
1、解压LAMMPS源代码:
tar -zxvf lammps-2021-11-18.tar.gz
2、进入解压后的文件夹:
cd lammps-2021-11-18
3、创建一个构建目录:
mkdir build cd build
4、使用CMake构建LAMMPS:
cmake ..
5、编译LAMMPS:
make
编译完成后,在build
目录下会生成一个名为lmp
的可执行文件。
配置LAMMPS
1、创建LAMMPS输入文件
在LAMMPS安装目录下的examples
文件夹中,有许多示例输入文件,您可以根据自己的需求选择一个示例文件,复制到工作目录中。
cp /path/to/lammps-2021-11-18/examples/mdi/in.mdi .
2、修改输入文件
打开in.mdi
文件,根据您的模拟需求修改参数,设置模拟系统的盒子大小、原子类型、原子间相互作用等。
3、运行LAMMPS
在终端中运行以下命令,启动LAMMPS模拟:
./lmp < in.mdi > output.log
<
表示从in.mdi
文件读取输入,>
表示将输出重定向到output.log
文件。
常见问题
1、编译报错:检查是否安装了所有依赖,以及依赖版本是否正确。
2、运行报错:检查输入文件是否正确,以及模拟参数是否合理。
3、模拟速度慢:尝试优化参数,或者使用并行计算功能。
以下是根据文章生成的50个中文相关关键词:
openSUSE, LAMMPS, 配置, 安装, 依赖, 编译, 源代码, 输入文件, 模拟, 参数, 并行计算, 运行, 报错, 优化, 版本, 系统要求, CPU, 内存, 硬盘, 下载, 解压, 构建目录, CMake, make, 可执行文件, 示例, 修改, 启动, 输出, 日志, 问题, 检查, 合理, 速度, 优化, 性能, 计算, 模拟器, 动力学, 材料, 科学, 生物物理, 化学, 研究人员, 应用, 功能, 库, 工具
本文标签属性:
配置指南:家庭无线路由器配置指南
openSUSE LAMMPS 配置:opensuse使用