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本文详细介绍在opENSUSE操作系统中安装和配置LAMMPS(大规模原子/分子大规模并行模拟器)的步骤,涵盖从安装依赖、编译源码到运行测试案例的完整流程,为openSUSE用户提供了详尽的LAMMPS配置指南。
本文目录导读:
在科学计算领域,LAMMPS(Large-scale Atomic/Molecular Massively Parallel Simulator)是一款非常强大的分子动力学模拟软件,本文将详细介绍如何在openSUSE操作系统下配置LAMMPS,帮助用户顺利完成安装和基本设置。
准备工作
1、确保openSUSE操作系统已安装好,推荐使用最新版本的openSUSE。
2、安装必要的编译工具和依赖库,执行以下命令:
sudo zypper install gcc gcc-c++ make cmake git
3、获取LAMMPS源代码,可以从LAMMPS官方网站(https://lammps.sandia.gov/)下载最新版本的源代码,或者使用git克隆:
git clone https://github.com/lammps/lammps.git
编译LAMMPS
1、进入LAMMPS源代码目录:
cd lammps/src
2、创建一个构建目录并进入:
mkdir build cd build
3、使用cmake进行编译配置,这里以最常用的MPI并行版本为例,执行以下命令:
cmake ..
4、根据需要启用或禁用特定的功能,启用KOKKOS加速:
cmake -DKOKKOS=on ..
5、开始编译:
make
编译完成后,会在当前目录下生成可执行文件lmp
。
安装LAMMPS
1、将编译好的LAMMPS安装到系统中:
sudo make install
默认安装路径为/usr/local/lammps
。
2、配置环境变量,编辑~/.bashrc
文件,在文件末尾添加以下内容:
export PATH=/usr/local/lammps/bin:$PATH export LD_LIBRARY_PATH=/usr/local/lammps/lib:$LD_LIBRARY_PATH
3、刷新环境变量:
source ~/.bashrc
验证安装
1、运行一个简单的LAMMPS示例,例如in.lj
:
lmp -in in.lj
2、如果LAMMPS能够正常运行并输出结果,则表示安装成功。
注意事项
1、LAMMPS的编译和安装过程中,可能会遇到各种依赖问题,建议参考LAMMPS官方文档和社区经验,逐步解决。
2、如果需要使用特定的LAMMPS功能,请在编译前查阅官方文档,了解所需依赖和编译选项。
3、在实际使用中,根据计算需求选择合适的LAMMPS版本和编译选项,以获得最佳性能。
以下是为本文生成的50个中文相关关键词:
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openSUSE:openSUSE中文社区
LAMMPS配置:lammps配置环境变量
openSUSE LAMMPS 配置:opensuse配置网络