推荐阅读:
[AI-人工智能]免翻墙的AI利器:樱桃茶·智域GPT,让你轻松使用ChatGPT和Midjourney - 免费AIGC工具 - 拼车/合租账号 八折优惠码: AIGCJOEDISCOUNT2024
[AI-人工智能]银河录像局: 国内可靠的AI工具与流媒体的合租平台 高效省钱、现号秒发、翻车赔偿、无限续费|95折优惠码: AIGCJOE
[AI-人工智能]免梯免翻墙-ChatGPT拼车站月卡 | 可用GPT4/GPT4o/o1-preview | 会话隔离 | 全网最低价独享体验ChatGPT/Claude会员服务
[AI-人工智能]边界AICHAT - 超级永久终身会员激活 史诗级神器,口碑炸裂!300万人都在用的AI平台
本文详细介绍在opENSUSE操作系统中配置LAMMPS(大规模原子/分子大规模并行模拟器)的步骤,同时涵盖openSUSE下无线网络的设置方法,助力用户顺利完成LAMMPS的安装和调试。
本文目录导读:
LAMMPS(Large-scale Atomic/Molecular Massively Parallel Simulator)是一款强大的分子动力学模拟软件,广泛应用于材料科学、生物物理、化学等领域,本文将详细介绍如何在openSUSE操作系统下安装和配置LAMMPS,帮助读者顺利开展分子动力学模拟工作。
安装编译依赖
1、安装编译器
确保系统中已安装CMake和GCC编译器,在openSUSE中,可以使用以下命令安装:
sudo zypper install cmake gcc gcc-c++ make
2、安装并行计算库
LAMMPS支持并行计算,因此需要安装MPI(Message Passing Interface)库,在openSUSE中,可以使用以下命令安装:
sudo zypper install openmpi openmpi-devel
下载LAMMPS源代码
1、访问LAMMPS官方网站(https://lammps.sandia.gov/),在“Download”页面下载最新版本的源代码。
2、将下载的源代码压缩包解压到指定目录,/home/username/lammps/src
编译LAMMPS
1、进入LAMMPS源代码目录:
cd /home/username/lammps/src
2、创建一个构建目录:
mkdir build cd build
3、使用CMake配置编译选项,这里以安装并行计算库为例,配置如下:
cmake -D CMAKE_INSTALL_PREFIX=/usr/local/lammps ..
4、编译LAMMPS:
make
5、安装LAMMPS:
sudo make install
配置LAMMPS
1、修改环境变量
在~/.bashrc
文件中添加以下内容:
export PATH=/usr/local/lammps/bin:$PATH export LD_LIBRARY_PATH=/usr/local/lammps/lib:$LD_LIBRARY_PATH
运行以下命令使环境变量生效:
source ~/.bashrc
2、配置LAMMPS参数
在LAMMPS的安装目录下,有一个名为lammps.src
的文件,该文件包含了LAMMPS的默认参数,用户可以根据自己的需求修改该文件,
lammps.src
使用LAMMPS进行模拟
1、编写输入脚本
在LAMMPS中,模拟过程是通过输入脚本来控制的,用户需要根据自己的模拟需求编写输入脚本,
input.lammps units metal dimension 3 boundary p p p atom_style atomic read_data data.lammps pair_style lj/cut 2.5 neighbor 2.0 bin neigh_modify delay 0 every 1 check yes thermo 100 dump id all atom 100 dump.lammps id run 1000
2、运行LAMMPS
在命令行中输入以下命令运行LAMMPS:
lmp < input.lammps
本文详细介绍了在openSUSE操作系统下安装和配置LAMMPS的过程,包括编译依赖的安装、LAMMPS源代码的下载、编译、安装、配置以及使用LAMMPS进行模拟,希望对读者有所帮助。
以下为50个中文相关关键词:
openSUSE, LAMMPS, 配置, 编译, 安装, 依赖, MPI, 源代码, 构建目录, 环境变量, 输入脚本, 模拟, 参数, 并行计算, 编译器, 下载, 解压, 构建目录, 配置选项, 安装目录, 环境变量配置, 参数修改, 模拟过程, 脚本编写, 运行命令, 软件安装, 科学计算, 分子动力学, 材料科学, 生物物理, 化学领域, 模拟软件, 计算机模拟, 高性能计算, 并行处理, 优化配置, 调试技巧, 使用心得, 模拟案例, 学习资料, 常见问题, 解决方案, 使用技巧, 模拟教程, 分子动力学模拟, 软件教程, 计算机辅助设计
本文标签属性:
无线网络配置:无线网络配置常用的三种模板
openSUSE LAMMPS 配置:opensuse15.3